R CMD チェック WARNINGS を実行しており、現在、以下の WARNING メッセージに取り組んでいます。
* checking for missing documentation entries ... WARNING
Undocumented code objects:
‘diagnoses’
Undocumented data sets:
‘diagnoses’
現在、R パッケージ スケルトンの data/ フォルダーに .RData ファイルがあります。このファイルには、RData コンテンツを読み込むときに読み込まれる R オブジェクトが 1 つだけではなく 2 つ含まれています。ただし、両方の R オブジェクトを宣言して、roxgenise() を実行し、その後の R CMD チェックを実行するときにマニュアル ページがそれを取得する方法を説明するドキュメントを見つけることができません。
これまでのところ、「@format」タグを使用してデータセットのマニュアル ページに両方の R オブジェクトを文書化しようとしています。「@format」の代わりに「@return」タグも試しましたが、警告は続きます。R オブジェクトの名前が RData ファイルの名前と一致する場合が好きであることに気付きました。したがって、Miller2015 R オブジェクトは文書化されていないと報告されていませんが、診断用の data.frame は文書化されていません。
#' @title Untargeted metabolomic analysis for the clinical screening of inborn errors
#' of metabolism
#'
#' @description Global metabolic profiling obtained by untargeted mass spectrometry-based
#' metabolomic platform for the detection of novel and known inborn errors of
#' metabolism.
#'
#' @name Miller2015
#' @aliases Miller2015
#' @docType data
#' @usage data(Miller2015)
#' @format Miller2015 - The data frame with 1203 metabolite features as rows, and 186 untargeted metabolomics patient samples as columns, alongside 16 metabolite annotations.
#' @format diagnoses - A data.frame where all patient IDs are mapped to their given biochemical diagnosis.
#' @keywords datasets
#' @references Miller et al. (2015) J Inherit Metab Dis. 2015; 38: 1029–1039
#' (\href{https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4626538/}{PubMed})
#' @source \href{https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4626538/bin/10545_2015_9843_MOESM1_ESM.xls}{Dataset}
#'
#' @examples
#' require(CTD)
#' data(Miller2015)
"Miller2015"
R オブジェクトを個別の RData ファイルに分割せずに、この WARNING を解決するにはどうすればよいですか? ベストプラクティスとは?