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PDBバインディングデータを引き出す

PDBファイルから残基とヘタトム座標を取り出して、接触残基が何であるかを評価したいと思います。

次に、これらの残基をアラインメントと比較したいと思います。これらの残基が alignmet で保存されている場合は、それらの残基にスターを付けます。これを行う理由は、多対多の配置で最初の「ヒット」が 15,000 行あるためです。

誰かがこれを読んで正しい方向に私を向けることができますか?

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