このようなzooオブジェクトを含むファイルがいくつかあります(各ファイルは異なる日付で開始および終了します):
code pp
1942-06-01 4016 0
1942-06-02 4016 NA
1942-06-03 4016 0
1942-06-04 4016 0
1942-06-05 NA 0
1942-06-06 NA 0
9月、10月、11月のすべてのファイルのpp間で相関行列を作成したいと思います(誰が誰であるかを識別できるようにコードを表示します)。コード列にNAがあるため、list.files関数(異なるファイル間の相関行列でJoranから提供されたコード)を使用できません。だから私は次のコードを思いついた:
files <- list.files(pattern=".csv")
xx<-read.zoo(files[1],sep=",", header=TRUE,index.column=1)
name<- as.name(xx$code[[1]])
colnames(xx) <- c("code", name)
x<-xx[months(time(xx), TRUE) %in% c("Sep", "Oct", "Nov")]
yy<-read.zoo(files[2],sep=",", header=TRUE,index.column=1)
name<- as.name(yy$code[1])
colnames(yy) <- c("code", name)
y<-yy[months(time(yy), TRUE) %in% c("Sep", "Oct", "Nov")]
CET<-merge(x, y, all = TRUE, fill = NA, check.names=FALSE)
for (i in 3:length(files))
{
z<-read.zoo(files[i],sep=",", header=TRUE,index.column=1)
name<- as.name(z$code[1])
colnames(z) <- c("code", name)
CET<-merge(CET, z, all = TRUE, fill = NA, check.names=FALSE)
}
a<-1:(dim(CET)[2])
even <- a[ a%%2 == 0 ]
# saves the precipitation column (even numbers) and discards the code ones
dat<-CET[,even]
c.mat<-cor(dat,use="pairwise.complete.obs" )
しかし、何かが間違っています。相関行列では、列/行の名前の一部に余分な「.z」または「.CET」があり、最も重要なのは、相関係数が正しくないことです。私は問題を見つけることができないので、問題を見つけるか、これを行うためのより簡単なコードを提案する助けがあれば非常にありがたいです!