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私はWindows7を使用しています。Python2.7とBiopython1.57をインストールしました。次のスクリプトを作成しました。

from Bio.Clustalw import MultipleAlignCL 
cl = MultipleAlignCL("myseqs.fasta") 
print("Command line: %s"%cl) 
clpath="C:\Program Files\ClustalW2\clustalw2.exe" 
cl = MultipleAlignCL("myseqs.fasta",command=clpath) 

from Bio.Clustalw import do_alignment align = do_alignment(cl) 

しかし、エラーメッセージが表示されました。

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これは言葉遣いの悪い質問です。詳細はどこにありますか?

コマンドラインで ClustalW を手動でインストールして実行できましたか? バージョンは?どのバージョンの Biopython を試しましたか? どのOSを使用していますか(大きな違いを生む可能性があります)? どのようなエラー メッセージが表示されましたか?

Biopython チュートリアルで ClustalW を実行する例を試しましたか? http://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.htmlまたはhttp://biopython.org/DIST/docs/tutorial/Tutorial.pdf

于 2011-06-22T12:01:10.067 に答える