jupyter-notebook - to_crs を実行して geodataframe のジオメトリを変換するとカーネルが停止する

Question

Python 3 を実行している Jupyter Notebook で geodataframe のジオメトリを EPSG4326 から EPSG3857 に変換しようとすると、カーネルが停止し続けます。

最小限の再現可能なコード:

df = pd.DataFrame(
    {'City': ['A', 'B', 'C', 'D', 'E'],
     'Country': ['1', '2', '3', '4', '5'],
     'Latitude': [-34.58, -15.78, -33.45, 4.60, 10.48],
     'Longitude': [-58.66, -47.91, -70.66, -74.08, -66.86]})

crs = {'init': 'epsg:4326'}

gdf = gpd.GeoDataFrame(
    df, crs=crs, geometry=gpd.points_from_xy(df.Longitude, df.Latitude))

gdf.geometry = gdf.geometry.to_crs(epsg=3857)

この閉鎖されたGithubの問題で解決策を試しました-つまり、PyProjの最新バージョンに更新します。これは私にとって問題を解決しません。

また、ジオパンダ専用の新しい conda 環境を作成してみました。これでも問題は解決しません。

Python ターミナル スクリプトで最小限の再現可能なコードを実行すると、Fiona の問題を示す次の出力が得られます。

(geo) RichardgrimsMBP:desktop data_science$ python tocrs.py
Traceback (most recent call last):
File "tocrs.py", line 4, in
import geopandas as gpd
File "/opt/anaconda3/envs/geo/lib/python3.8/site-packages/geopandas/init.py", line 7, in
from geopandas.io.file import _read_file as read_file # noqa
File "/opt/anaconda3/envs/geo/lib/python3.8/site-packages/geopandas/io/file.py", line 7, in
import fiona
File "/opt/anaconda3/envs/geo/lib/python3.8/site-packages/fiona/init.py", line 86, in
from fiona.collection import BytesCollection, Collection
File "/opt/anaconda3/envs/geo/lib/python3.8/site-packages/fiona/collection.py", line 11, in
from fiona.ogrext import Iterator, ItemsIterator, KeysIterator
ImportError: dlopen(/opt/anaconda3/envs/geo/lib/python3.8/site-packages/fiona/ogrext.cpython-38-darwin.so, 2): Symbol not found: _CCCryptorGCMFinalize
Referenced from: /opt/anaconda3/envs/geo/lib/libtiledb.dylib (which was built for Mac OS X 10.13)
Expected in: /usr/lib/libSystem.B.dylib
in /opt/anaconda3/envs/geo/lib/libtiledb.dylib