rsync から紛らわしいエラーが発生し、Web 検索 (および通常のすべての chmod'ing) から最初に見つけたものはそれを解決していません:
rsync: failed to set times on "/foo/bar": Operation not permitted (1)
rsync error: some files could not be transferred (code 23)
at /SourceCache/rsync/rsync-35.2/rsync/main.c(992) [sender=2.6.9]
そのエラーにもかかわらず機能しているようですが、それを取り除くといいでしょう。