ONT basecaller guppy を実行しようとしました。私は問題なくこのコードを数回実行しました。現在(再起動後)、エラーメッセージが生成されています:
[guppy/error] main: CUDA error at /builds/ofan/ont_core_cpp/ont_core/common/cuda_common.cpp:203: CUDA_ERROR_COMPAT_NOT_SUPPORTED_ON_DEVICE [guppy/warning] main: An error occurred in the basecaller. Aborting.
これは互換性の問題ですか? もしそうなら、どうすれば解決できますか? Ubuntu 18.04.4 LTS (GNU/Linux 5.4.0-72-generic x86_64) と Guppy Basecalling Software、(C) Oxford Nanopore Technologies, Limited を使用しています。バージョン 4.0.14+8d3226e、クライアントサーバー API バージョン 2.1.0
ここに私のグッピーコードがあります:
guppy_basecaller -i fast5/pass -r --device cuda:0 -s hac_fastqs_demul -c /opt/ont/ont-guppy/data/dna_r9.4.1_450bps_hac.cfg --num_callers 4 --require_barcodes_both_ends --trim_barcodes --detect_mid_strand_barcodes --barcode_kits "EXP-PBC001"