R を再起動せずにパッケージをアンロードしたい (ほとんどの場合、別の競合するパッケージを試して R を再起動するとイライラするためですが、これをプログラムで使用して、ある関数を使用し、次に別の関数を使用することができます。参照することは、その用途にはおそらくより良い考えです)。
?libraryパッケージをアンロードするオプションは表示されません。
パッケージをアンロードできる提案がありdetachますが、次の両方が失敗します。
detach(vegan)
エラー
detach(vegan): 無効なname引数
detach("vegan")
エラー
detach("vegan"): 無効なname引数
では、パッケージをアンロードするにはどうすればよいでしょうか。
これを試してください (詳細については、を参照?detachしてください)。
detach("package:vegan", unload=TRUE)
パッケージの複数のバージョンを一度にロードすることができます (たとえば、異なるライブラリに開発バージョンと安定バージョンがある場合)。すべてのコピーが確実に切り離されるようにするには、この関数を使用します。
detach_package <- function(pkg, character.only = FALSE)
{
if(!character.only)
{
pkg <- deparse(substitute(pkg))
}
search_item <- paste("package", pkg, sep = ":")
while(search_item %in% search())
{
detach(search_item, unload = TRUE, character.only = TRUE)
}
}
使い方は、例えば
detach_package(vegan)
また
detach_package("vegan", TRUE)
unloadNamespace次のようにコマンドを使用することもできます。
unloadNamespace("sqldf")
この関数は、名前空間をアンロードする前に切り離します。
RStudio（パッケージ）のチェックボックスボタンをオフにすることができます。
kohske が回答として書いたものを試してみたところ、再びエラーが発生したため、検索を行ったところ、これがうまくいったことがわかりました (R 3.0.2):
require(splines) # package
detach(package:splines)
またはまた
library(splines)
pkg <- "package:splines"
detach(pkg, character.only = TRUE)
を使用して、パッケージ (および一緒に持ち込まれたすべての依存関係) を削除したいすべてを試すことができますunloadNamespace()が、メモリ フットプリントは依然として持続します。いいえ、detach("package:,packageName", unload=TRUE, force = TRUE)どちらも機能しません。
新しいコンソールから、またはパッケージSession > Restart Rでメモリを確認します。pryr
pryr::mem_used()
# 40.6 MB ## This will depend on which packages are loaded obviously (can also fluctuate a bit after the decimal)
私のチェックsessionInfo()
R version 3.6.1 (2019-07-05)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17763)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=English_Canada.1252 LC_CTYPE=English_Canada.1252 LC_MONETARY=English_Canada.1252 LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_Canada.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] compiler_3.6.1 pryr_0.1.4 magrittr_1.5 tools_3.6.1 Rcpp_1.0.3 stringi_1.4.3 codetools_0.2-16 stringr_1.4.0
[9] packrat_0.5.0
Seuratパッケージをロードして、新しいメモリ フットプリントを確認しましょう。
library(Seurat)
pryr::mem_used()
# 172 MB ## Likely to change in the future but just to give you an idea
unloadNamespace()すべてを削除するために使用しましょう:
unloadNamespace("Seurat")
unloadNamespace("ape")
unloadNamespace("cluster")
unloadNamespace("cowplot")
unloadNamespace("ROCR")
unloadNamespace("gplots")
unloadNamespace("caTools")
unloadNamespace("bitops")
unloadNamespace("fitdistrplus")
unloadNamespace("RColorBrewer")
unloadNamespace("sctransform")
unloadNamespace("future.apply")
unloadNamespace("future")
unloadNamespace("plotly")
unloadNamespace("ggrepel")
unloadNamespace("ggridges")
unloadNamespace("ggplot2")
unloadNamespace("gridExtra")
unloadNamespace("gtable")
unloadNamespace("uwot")
unloadNamespace("irlba")
unloadNamespace("leiden")
unloadNamespace("reticulate")
unloadNamespace("rsvd")
unloadNamespace("survival")
unloadNamespace("Matrix")
unloadNamespace("nlme")
unloadNamespace("lmtest")
unloadNamespace("zoo")
unloadNamespace("metap")
unloadNamespace("lattice")
unloadNamespace("grid")
unloadNamespace("httr")
unloadNamespace("ica")
unloadNamespace("igraph")
unloadNamespace("irlba")
unloadNamespace("KernSmooth")
unloadNamespace("leiden")
unloadNamespace("MASS")
unloadNamespace("pbapply")
unloadNamespace("plotly")
unloadNamespace("png")
unloadNamespace("RANN")
unloadNamespace("RcppAnnoy")
unloadNamespace("tidyr")
unloadNamespace("dplyr")
unloadNamespace("tibble")
unloadNamespace("RANN")
unloadNamespace("tidyselect")
unloadNamespace("purrr")
unloadNamespace("htmlwidgets")
unloadNamespace("htmltools")
unloadNamespace("lifecycle")
unloadNamespace("pillar")
unloadNamespace("vctrs")
unloadNamespace("rlang")
unloadNamespace("Rtsne")
unloadNamespace("SDMTools")
unloadNamespace("Rdpack")
unloadNamespace("bibtex")
unloadNamespace("tsne")
unloadNamespace("backports")
unloadNamespace("R6")
unloadNamespace("lazyeval")
unloadNamespace("scales")
unloadNamespace("munsell")
unloadNamespace("colorspace")
unloadNamespace("npsurv")
unloadNamespace("compiler")
unloadNamespace("digest")
unloadNamespace("R.utils")
unloadNamespace("pkgconfig")
unloadNamespace("gbRd")
unloadNamespace("parallel")
unloadNamespace("gdata")
unloadNamespace("listenv")
unloadNamespace("crayon")
unloadNamespace("splines")
unloadNamespace("zeallot")
unloadNamespace("reshape")
unloadNamespace("glue")
unloadNamespace("lsei")
unloadNamespace("RcppParallel")
unloadNamespace("data.table")
unloadNamespace("viridisLite")
unloadNamespace("globals")
今チェックしてくださいsessionInfo()：
R version 3.6.1 (2019-07-05)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows 10 x64 (build 17763)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=English_Canada.1252 LC_CTYPE=English_Canada.1252 LC_MONETARY=English_Canada.1252 LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_Canada.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_3.6.1 stringr_1.4.0 rstudioapi_0.10 pryr_0.1.4 jsonlite_1.6 gtools_3.8.1 R.oo_1.22.0
[8] magrittr_1.5 Rcpp_1.0.3 R.methodsS3_1.7.1 stringi_1.4.3 plyr_1.8.4 reshape2_1.4.3 codetools_0.2-16
[15] packrat_0.5.0 assertthat_0.2.1
メモリ フットプリントを確認します。
pryr::mem_used()
# 173 MB
また、ご利用はunload()1回限りとなりますのでご了承ください。を再実行せずに 2 回目に使用すると、library()あまり有益ではないエラー メッセージが表示されます。
library(vegan)
#> Loading required package: permute
#> Loading required package: lattice
#> This is vegan 2.5-6
detach("package:vegan", unload=TRUE)
detach("package:vegan", unload=TRUE)
#> Error in detach("package:vegan", unload = TRUE): invalid 'name' argument
reprex パッケージ(v0.3.0)により 2020-05-09 に作成