自分で関数を書く必要があると思います。最初は、必要以上に2桁の精度で数値の科学的表現を得ることができます。次に、結果の文字列を解析して、浮動小数点係数と10の累乗インデックスを10進数型の数値として取得する必要があります。その後、除算インデックスの余りを3で分析し、適切な方法で数値を変更します。最後に、出力文字列を生成します。
static string Scientific3(double value, int precision)
{
string fstr1 = "{0:E" + (precision+2).ToString() + "}";
string step1 = string.Format(fstr1, value);
int index1 = step1.ToLower().IndexOf('e');
if (index1 < 0 || index1 == step1.Length - 1)
throw new Exception();
decimal coeff = Convert.ToDecimal(step1.Substring(0, index1));
int index = Convert.ToInt32(step1.Substring(index1 + 1));
while(index%3!=0)
{
index--;
coeff *= 10;
}
string fstr2 = "{0:F" + precision.ToString() + "}E{1}{2:D3}";
return string.Format(fstr2, coeff, ((index < 0) ? "-" : "+"), Math.Abs(index));
}