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を使用して、流水と温度勾配のあるリング チューブをシミュレートしていdeSolve::ode()ます。リングは、各要素が温度値と位置を持つベクトルとしてモデル化されます。

私は熱拡散式をモデル化しています:

1)熱拡散

しかし、リングに沿って水を動かすのにも苦労しています。理論的には、チューブ ベクトルの要素iの温度を要素s の場所の温度に置き換えるだけです。sは整数ではない可能性があるため、整数部分 ( n ) と小数部分 ( p )に分けることができます: s=n+p . したがって、水の移動による温度変化は次のようになります。

2)水の流れ

問題は、ode ソルバーの各反復で評価されるdtによって、sが水の速度vに等しいことです。

私の考えは、現象を加法的に扱うことです。つまり、最初に (1) を計算し、次に (2) を計算し、最後にそれらを足し合わせます。時間の影響が怖いです。陰解法を使用する ode ソルバーは、時間ステップを自動的に決定し、ユニタリ変化デルタを線形に縮小します。

私の質問は、微分関数で (1) + (2) を返すだけが正しいのか、それとも 2 つのプロセスを分割して微分を別々に計算する必要があるのか​​ということです。2 番目のケースでは、どのようなアプローチが推奨されますか?

編集: @tpetzoldt の提案に従って、 を使用して水の流れを実装しようとしましたReacTran::advection.1D()。私のモデルには、温度の変動の複数の原因があります。自発対称熱拡散です。水の流れ; (熱源の前に配置された)センサー付近の温度が下限しきい値を下回った場合にオンになり、上限しきい値を超えた場合にオフになる熱源。周期的な外部温度によって決定される一定の熱分散。

「Moving water」セクションの下には、以前のバージョンのコードがまだあり、現在は に置き換えられていReacTran::advection.1D()ます。このplot_type引数により、水管 (「パイプ」) 内の温度の時系列、またはセンサーでの温度系列 (ヒーターの前後) のいずれかを視覚化できます。

library(deSolve)
library(dplyr)
library(ggplot2)
library(tidyr)
library(ReacTran)

test <- function(simTime = 5000, vel = 1, L = 500, thresh = c(16, 25), heatT = 25,
                                    heatDisp = .0025,   baseTemp = 15, alpha = .025,
                                    adv_method = 'up', plot_type = c('pipe', 'sensors')) {
    
    plot_type <- match.arg(plot_type)

    thresh <- c(16, 25)

    sensorP <- round(L/2)

    vec <- c(rep(baseTemp, L), 0)

    eventfun <- function(t, y, pars) {

        heat <- y[L + 1] > 0

        if (y[sensorP] < thresh[1] & heat == FALSE) { # if heat is FALSE -> T was above the threshold
            #browser()
            y[L + 1] <- heatT
        }

        if (y[sensorP] > thresh[2] & heat == TRUE) { # if heat is TRUE -> T was below the threshold
            #browser()
            y[L + 1] <- 0
        }

        return(y)
    }

    rootfun <- function (t, y, pars) {

        heat <- y[L + 1] > 0

        trigger_root <- 1

        if (y[sensorP] < thresh[1] & heat == FALSE & t > 1) { # if heat is FALSE -> T was above the threshold
            #browser()
            trigger_root <- 0
        }

        if (y[sensorP] > thresh[2] & heat == TRUE & t > 1) { # if heat is TRUE -> T was below the threshold
            #browser()
            trigger_root <- 0
        }


        return(trigger_root)
    }

    roll <- function(x, n) {
        x[((1:length(x)) - (n + 1)) %% length(x) + 1]
    }

    fun <- function(t, y, pars) {

        v <- y[1:L]

        # Heat diffusion: dT/dt = alpha * d2T/d2X
        d2Td2X <- c(v[2:L], v[1]) + c(v[L], v[1:(L - 1)]) - 2 * v

        dT_diff <- pars * d2Td2X

        # Moving water
        # nS <- floor(vel)
        # pS <- vel - nS
        #
        # v_shifted <- roll(v, nS)
        # nS1 <- nS + 1
        # v_shifted1 <- roll(v, nS + 1)
        #
        # dT_flow <- v_shifted + pS * (v_shifted1 - v_shifted) - v
        dT_flow <- advection.1D(v, v = vel, dx = 1, C.up = v[L], C.down = v[1],
                                                        adv.method = adv_method)$dC

        dT <- dT_flow + dT_diff

        # heating of the ring after the sensor
        dT[sensorP + 1] <- dT[sensorP  + 1] + y[L + 1]

        # heat dispersion
        dT <- dT - heatDisp * (v - baseTemp + 2.5 * sin(t/(60*24) * pi * 2))

        return(list(c(dT, 0)))
    }

    out <- ode.1D(y = vec, times = 1:simTime, func = fun, parms = alpha, nspec = 1,
                                    events = list(func = eventfun, root = T),
                                    rootfunc = rootfun)


    if (plot_type == 'sensors') {

        ## Trend of the temperature at the sensors levels
        out %>%
            {.[,c(1, sensorP + 1, sensorP + 3, L + 2)]} %>%
            as.data.frame() %>%
            setNames(c('time', 'pre', 'post', 'heat')) %>%
            mutate(Amb = baseTemp + 2.5 * sin(time/(60*24) * pi * 2)) %>%
            pivot_longer(-time, values_to = "val", names_to = "trend") %>%
            ggplot(aes(time, val)) +
            geom_hline(yintercept = thresh) +
            geom_line(aes(color = trend)) +
            theme_minimal() +
            theme(panel.spacing=unit(0, "lines")) +
            labs(x = 'time', y = 'T°', color = 'sensor')
    } else {

    ## Trend of the temperature in the whole pipe
    out %>%
        as.data.frame() %>%
        pivot_longer(-time, values_to = "val", names_to = "x") %>%
        filter(time %in% round(seq.int(1, simTime, length.out = 40))) %>%
        ggplot(aes(as.numeric(x), val)) +
        geom_hline(yintercept = thresh) +
        geom_line(alpha = .5, show.legend = FALSE) +
        geom_point(aes(color = val)) +
        scale_color_gradient(low = "#56B1F7", high = "red") +
        facet_wrap(~ time) +
        theme_minimal() +
        theme(panel.spacing=unit(0, "lines")) +
        labs(x = 'x', y = 'T°', color = 'T°')
    }
}

興味深いことに、より多くのセグメント ( L = 500) と高速 ( vel = 2) を設定すると、加熱後のセンサーでスパイク シーケンスを観察できます。また、処理時間も大幅に増加しますが、これはパイプ解像度の増加によるものではなく、速度の増加によるものです。

ここに画像の説明を入力

私の最大の疑問はReacTran::advection.1D()、私が水温をモデリングしているので、私のコンテキストで意味があるかどうかですが、この関数は流れる水の溶質の濃度に関連しているようです.

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この問題は、移動相と固定相をもつ偏微分方程式の例のように見えます。R/deSolve を使用した "ラインの方法" (MOL) アプローチに関する優れた紹介は、Soetaert と Meysman (2012) doi.org/10.1016/j.envsoft.2011.08.011による ReachTran に関する論文で見つけることができます。

PDE の例は、一部のワークショップ スライドのスライド 55 にあり、さらに教育パッケージRTMにあります。

R/deSolve/ReacTran は ODE/PDE を簡単にしようとしますが、落とし穴が残っています。数値の分散や振動が発生する場合は、Courant–Friedrichs–Lewy 条件の違反が原因である可能性があります。

于 2021-12-03T14:33:18.397 に答える