参照凡例ファイルを再フォーマットして、bcftools と互換性を持たせようとしています。
基本的に、私はこれから行く必要があります:
id position a0 a1 TYPE AFR AMR EAS EUR SAS ALL
1:123:A:T 123 A T SNP 0.01 0.01 0 0 0 0.01
1:679:A:T 123 A T SNP 0.01 0.01 0 0 0 0.01
これに:
id position a0 a1 TYPE AFR AMR EAS EUR SAS ALL
1:123_A_T 123 A T SNP 0.01 0.01 0 0 0 0.01
1:679_A_T 123 A T SNP 0.01 0.01 0 0 0 0.01
理想的にはbashを使用します。