HTML5/JavaScript Metro アプリケーションがどのようにパッケージ化され、元に戻されないように保護されるのかが気になります。
パッケージングには、ある種の署名付き zip/jar を期待します (MSDN の .appx については言及されていません) が、保護のためには、JavaScript の難読化を除けば、他の方法は考えられません (おそらく、新しいプリコンパイル済み/バイナリ形式ですか?)
保護が不十分な場合、HTML5/JavaScript アプリを作成してもあまり繁栄しません。