--with-eaccelerator-shared-memoryフラグを指定してeaccelerator 0.9.6.1をコンパイルしようとしましたが、その後:
./configure --with-eaccelerator-shared-memory
このメッセージを受け取りました：
configure: WARNING: unrecognized options: --with-eaccelerator-shared-memory
コンテンツ キャッシュを有効にする必要があるため、get_ および set_ 関数
ユーザーキャッシュ機能は 0.9.6 で削除されたため、スイッチ with-eaccelerator-shared-memory も削除されました。
https://eaccelerator.net/wiki/Release-0.9.6
古いバージョンは PHP 5.3 ではコンパイルできません。
最初に phpize を実行して、php のバージョンを取得しましたか? ボックスで configure --with-eaccelerator-shared-memory を実行したところ、次の出力が得られました。
gcc リンカー (/usr/bin/ld -m elf_x86_64) が共有ライブラリをサポートしているかどうかを確認しています... はい
リンカーが共有ライブラリの構築をサポートしていない可能性がありますか? gcc のインストールをもう一度確認してください (apt-get update)。