展開オプションが正しく設定されており、アップロードは問題なく動作します。プロジェクト全体だけでなく、個々のファイルもアップロードできます。
ただし、リモート ホスト パネルでは、個々のファイルが選択されている場合、ダウンロード/アップロード ボタンはグレー表示され、ルート パスが選択されている場合にのみアクティブになります。[ここからダウンロード] をクリックしても、[ファイル転送] ウィンドウに [ダウンロード] ステータスが表示されるだけです。
PyCharm docs は、展開構成がデフォルトとして指定されている場合にのみダウンロードが機能すると述べています。ただし、これはデフォルトの (そして唯一の) 構成です。
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