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私は、geneplotter (Bioconductor パッケージ) のインストール中にしました。Linux Mint 9 で R 2.14 を使用しています。これは名前空間が原因だと思いますが、修正方法がわかりません...

エラーは次のとおりです。

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("geneplotter")
BioC_mirror: 'http://www.bioconductor.org'
Using R version 2.14, BiocInstaller version 1.2.0.
Installing package(s) 'geneplotter'
Installing package(s) into ‘/home/nicolas/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14’
(as ‘lib’ is unspecified)
essai de l'URL 'http://www.bioconductor.org/packages/2.9/bioc/src/contrib/geneplotter_1.31.4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1387616 bytes (1.3 Mb)
URL ouverte
==================================================
downloaded 1.3 Mb

* installing *source* package ‘geneplotter’ ...
** R
** data
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices ...
*** tangling vignette sources ...
   ‘byChroms.Rnw’ 
   ‘visualize.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded
Error in namespaceExport(ns, exports) : 
  undefined exports: .__C__file, .__C__connection
Erreur : le chargement a échoué
Exécution arrêtée
ERREUR : le chargement a échoué
* removing ‘/home/nicolas/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14/geneplotter’

The downloaded packages are in
    ‘/tmp/RtmpO1aY1T/downloaded_packages’
Message d'avis :
In install.packages(pkgs = pkgs, repos = repos, ...) :
  installation of package ‘geneplotter’ had non-zero exit status

前もって感謝します、

N.

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これをさらに詳しく調べると、初期リリースのgeneplotter ビルドに失敗しました。したがって、選択しているバージョンは最後から 2 番目のバージョンです。あなたが特定した問題は、次のビルド サイクルに間に合うように昨日修正されました。geneplotterおそらくPDTの正午に、正しくビルドされたときに正しくインストールする必要があります。バージョン 1.32.1 を探します。振り返ってみると、SOの質問ではありません。Bioconductorメーリング リストには、購読を必要としない投稿機能があります。

于 2011-11-02T14:53:31.677 に答える