一部の画像やコードを一時的にローカルにキャッシュする場合を除いて、Isolated Storage の価値はあまりありません。1MBしか得られないので、これでもあまり価値がありません。ユーザーが別のマシンの別のブラウザーから Silverlight アプリケーションにアクセスできるため、分離ストレージに設定を保存してもあまり意味がありません。
プラスの設定は、サーバーに保存されたほうが理にかなっています。
私が見落としている可能性があることに対して、IsolatedStorage を何に使用していますか?