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データフレーム内のすべての行の相互の相対的なピアソン相関係数を取得しようとしています。空の値（NA）があり、これは、値が欠落している2つのベクトルでcor（）を実行するときに発生しない問題を示しているようです。これは、2つのベクトルでの正しい結果です。

x <- c(NA, 4.5, NA, 4, NA, 1)
y <- c(2.5, 3.5, 3, 3.5, 3, 2.5)
cor(x,y, use = "complete.obs")
[1] 0.9912407

これらがデータフレームの一部である場合の結果は次のとおりです。

cor(t(critics1), use = "complete.obs")
   y  a  b  c  d  e  x
y  1 NA NA NA NA NA NA
a NA  1  1  1 -1  1 -1
b NA  1  1  1 -1  1 -1
c NA  1  1  1 -1  1 -1
d NA -1 -1 -1  1 -1  1
e NA  1  1  1 -1  1 -1
x NA -1 -1 -1  1 -1  1
Warning message:
In cor(t(critics1), use = "complete.obs") : the standard deviation is zero

使用パラメータが同じ効果を持たないのはなぜですか？critics1データフレームは次のようになります。

film1 film2 film3 film4 film5 film6
y   2.5   3.5   3.0   3.5   3.0   2.5
a   3.0   3.5   1.5   5.0   3.0   3.5
b   2.5   3.0    NA   3.5   4.0    NA
c    NA   3.5   3.0   4.0   4.5   2.5
d   3.0   4.0   2.0   3.0   3.0   2.0
e   3.0   4.0    NA   5.0   3.0   3.5
x    NA   4.5    NA   4.0    NA   1.0
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1 に答える 1

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@joranが推測したように、転置するとcritics1、完全な観測値は2つだけになります（つまり、欠落値のない行）。そのため、すべての相関は1orまたは-1or（y両方の完全な行で値3.5を持つを含むものの場合）、NAです。

t(critics1)
#         y   a   b   c d   e   x
# film1 2.5 3.0 2.5  NA 3 3.0  NA
# film2 3.5 3.5 3.0 3.5 4 4.0 4.5
# film3 3.0 1.5  NA 3.0 2  NA  NA
# film4 3.5 5.0 3.5 4.0 3 5.0 4.0
# film5 3.0 3.0 4.0 4.5 3 3.0  NA
# film6 2.5 3.5  NA 2.5 2 3.5 1.0

use="pairwise.complete.obs"の代わりにを使用するとuse="complete.obs"、希望どおりに機能します。

cor(t(df), use="pairwise.complete.obs")["y","x"] # Extract correlation of y and x
# [1] 0.9912407
于 2011-12-06T19:19:48.650 に答える