node.jsを使用してHTMLファイルにいくつかの変更を加えています。HTMLパーサーとしてjsdomを使用しており（解析は正規表現よりも信頼性が高いため）、jQueryで必要な変更を行ってから、出力をファイルに渡します。十分に単純です。
ただし、PHPファイルを処理しようとすると問題が発生します。パーサーの出力は、すべてのPHPコードを自然にチャックします（HTMLではないため、またコンテンツではないため、doctypeも同様です）。そのため、出力を直接使用することはできなくなりました。
HTML部分を解析および変更し、PHPコードを保持する方法についてのアイデアはありますか？