私の質問はタンパク質配列アラインメントに関連しています。alignmnetにClustalWを使用すると、同一性のパーセンテージが非常に類似しており、毎週類似していることがわかります。しかし、Identityではなくすべての整列された配列の類似性のパーセンテージを見つけたいと思います。
私はそれを解決するためのアルゴリズムを見つけるのに役立つソフトウェアを探しましたが、それらをダウンロードできませんex：MStatXこれは私の問題を解決するために有望に聞こえますが、どういうわけかそれをダウンロードするための情報を見つけることができません。
シーケンスの類似性のパーセンテージを計算するための1つのソリューションのように見える類似性マトリックスについても読みました。それでも、ソフトウェアがあればダウンロードするための情報がどこにあるのかわかりません。
複数の整列されたシーケンスの類似性パーセンテージを計算するための適切なツールまたは方法を見つけるのを手伝ってくれる人はいますか？
ありがとう、パヴィスラ。