タイトルですでに述べたように、問題の可能性を教えてください。
指示
hadoop jar /usr/lib/hadoop/contrib/streaming/hadoop-streaming-0.20.2-cdh3u2.jar \
-input /usr/pkansal/ex2/output \
-output /usr/pkansal/ex2/output2 \
-mapper /home/cloudera/ex2/kMerFreqMap2.py \
-ファイル /home/cloudera/ex2/kMerFreqMap2.py \
-numReduceTasks 0 (この行にコメントを付けるとうまくいく)
I/P
3 chr1:1,chr1:3,chr1:5
1ch1:7
2 chr1:2,chr1:4
1ch1:6
期待されるO/P
chr1 1 3
chr1 3 3
chr1 5 3
chr1 7 1
chr1 2 2
chr1 4 2
chr1 6 1
実際の O/P
chr1 2 2
chr1 4 2
chr1 6 1