maven-assembly-plugin を使用できます。1 つはメイン クラスを指定し、すべての依存関係を 1 つの jar にパッケージ化する 2 つの実行で、クラスパスは必要ありません。2 回目の実行では、すべての構成ファイルが同じ jar に配置されます。最後に、zip ファイルにマニフェスト ファイルを含む jar がある exe はありません。
<plugin>
<groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
<artifactId>maven-assembly-plugin</artifactId>
<version>2.2-beta-5</version>
<executions>
<execution>
<id>make-assembly1</id>
<phase>package</phase>
<goals>
<goal>single</goal>
</goals>
<configuration>
<archive>
<manifest>
<mainClass>com....class.with.the.main</mainClass>
</manifest>
</archive>
<descriptorRefs>
<descriptorRef>jar-with-dependencies</descriptorRef>
</descriptorRefs>
</configuration>
</execution>
<execution>
<id>make-assembly2</id>
<phase>package</phase>
<goals>
<goal>single</goal>
</goals>
<configuration>
<descriptors>
<descriptor>distribution.xml</descriptor>
</descriptors>
</configuration>
</execution>
</executions>
</plugin>