ああ、ついに私の問題を見つけました。
私は Visual Studio 2012 を使用していますが、これは常に「不足している」ファイルを指摘するとは限らず、修正が少し難しくなります。
私の短い解決策
メイン プロジェクトで「リンクされた」構成ファイルを再リンクします。元のファイルが現在のアセンブリではなく参照アセンブリに残るため、これはリンクされたファイルです。ファイルは YELLOW とマークされていなかったので、問題があるかどうかはわかりませんでしたが、ダブルクリックしても開かなかったので、これが問題のファイルであることがわかりました。
Silverlight アプリケーション自体には、「ServiceReferences.ClientConfig」という名前の「リンクされた」ファイルがありました。このファイルには、参照されるプロジェクトが Web サービス呼び出しを行うために必要な情報が含まれています。
そのため、メイン プロジェクトには Web サービス参照自体がありませんでしたが、参照したプロジェクトが参照されていたため、「ServiceReferences.ClientConfig」ファイルがリンクされていました。
私の長い解決策
メイン プロジェクト ファイルを再ビルドし、コメント アウトし、プロジェクトごと、ファイルごとにプロジェクトを除外し、メイン プロジェクトを再度ビルドできるようになるまで続けます。その時点で、ソリューションのどの部分が問題を引き起こしているかが明確になるはずです。