MyEclipse がインストールされた Eclipse 3.3.2 を使用します。何らかの理由で、ファイルが build.xml と呼ばれていない場合、ant ファイルとして認識されません。*.xml のファイル関連付けには ant が含まれ、「'Ant Buildfile' コンテンツ タイプによってロックされています。
run-as メニューが壊れています。エディターの関連付けが機能しても、run-as は機能しません。
問題の ant ビルドファイルは正しくフォーマットされています。それらを build.xml と呼んだり、他の場所で使用したりすると、問題なく動作します。Eclipseは認識しないため、それらを実行できません。