Pythonでマージする必要がある2つのタブ区切りのcsvファイル(ヘッダー付き)があります。
また、マージされたファイルでは、ファイルを識別するために最後に列を追加したいと思います。ファイルは同じ形式ですが、後で分離する必要があるデータが異なるためです。したがって、出力の各行に「source」という列を追加します。これは、file1の場合は0、file2の場合は1です。
私はcsvモジュールを使用するところまで行きましたが、writerowは、書き込む各行の間に追加の改行文字を追加し、このコードはfile2から何も書き込みません。私はここで何が間違っているのですか?また、ラインオブジェクトに追加の列「source」を追加するにはどうすればよいですか?
import os, csv
path1 = os.path.abspath("../data/file1.txt")
path2 = os.path.abspath("../data/file2.txt")
merged_path = os.path.abspath('../data/output.txt')
# merge the two files for further processing
merged_file = csv.writer(open(merged_path, 'a'), delimiter = '\t')
#file1
fg = csv.reader(open(path1, 'r'), delimiter = '\t')
for line in fg:
if line[7] != '\N':
merged_file.writerow(line)
#file2
bg = csv.reader(open(path2, 'r'), delimiter = '\t')
for line in bg:
if line[16] != '\N':
merged_file.writerow(line)