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私はRパッケージGBMを、おそらく予測モデリングの最初の選択肢として使用しています。このアルゴリズムには多くの優れた点がありますが、「悪い点」の1つは、モデルコードを使用してR以外の新しいデータを簡単にスコアリングできないことです。SA​​Sまたは他のシステムで使用できるコードを記述したいと思います( SAS(IMLへのアクセスなし))。

次のデータセット(GBMマニュアルから)とモデルコードがあるとしましょう:

library(gbm)
set.seed(1234)
N <- 1000
X1 <- runif(N)
X2 <- 2*runif(N)
X3 <- ordered(sample(letters[1:4],N,replace=TRUE),levels=letters[4:1])
X4 <- factor(sample(letters[1:6],N,replace=TRUE))
X5 <- factor(sample(letters[1:3],N,replace=TRUE))
X6 <- 3*runif(N)
mu <- c(-1,0,1,2)[as.numeric(X3)]
SNR <- 10 # signal-to-noise ratio
Y <- X1**1.5 + 2 * (X2**.5) + mu
sigma <- sqrt(var(Y)/SNR)
Y <- Y + rnorm(N,0,sigma)
# introduce some missing values
#X1[sample(1:N,size=500)] <- NA
X4[sample(1:N,size=300)] <- NA
X3[sample(1:N,size=30)] <- NA
data <- data.frame(Y=Y,X1=X1,X2=X2,X3=X3,X4=X4,X5=X5,X6=X6)
# fit initial model

gbm1 <- gbm(Y~X1+X2+X3+X4+X5+X6, # formula
data=data, # dataset
var.monotone=c(0,0,0,0,0,0), # -1: monotone decrease,
distribution="gaussian", 
n.trees=2, # number of trees
shrinkage=0.005, # shrinkage or learning rate,
# 0.001 to 0.1 usually work
interaction.depth=5, # 1: additive model, 2: two-way interactions, etc.
bag.fraction = 1, # subsampling fraction, 0.5 is probably best
train.fraction = 1, # fraction of data for training,
# first train.fraction*N used for training
n.minobsinnode = 10, # minimum total weight needed in each node
cv.folds = 5, # do 5-fold cross-validation
keep.data=TRUE, # keep a copy of the dataset with the object
verbose=TRUE) # print out progress

pretty.gbm.treeこれで、次のように使用して個々の木を見ることができます

pretty.gbm.tree(gbm1,i.tree = 1)[1:7]

これは

   SplitVar SplitCodePred LeftNode RightNode MissingNode ErrorReduction Weight
0         2  1.5000000000        1         8          15      983.34315   1000
1         1  1.0309565491        2         6           7      190.62220    501
2         2  0.5000000000        3         4           5       75.85130    277
3        -1 -0.0102671518       -1        -1          -1        0.00000    139
4        -1 -0.0050342273       -1        -1          -1        0.00000    138
5        -1 -0.0076601353       -1        -1          -1        0.00000    277
6        -1 -0.0014569934       -1        -1          -1        0.00000    224
7        -1 -0.0048866747       -1        -1          -1        0.00000    501
8         1  0.6015416372        9        10          14      160.97007    469
9        -1  0.0007403551       -1        -1          -1        0.00000    142
10        2  2.5000000000       11        12          13       85.54573    327
11       -1  0.0046278704       -1        -1          -1        0.00000    168
12       -1  0.0097445692       -1        -1          -1        0.00000    159
13       -1  0.0071158065       -1        -1          -1        0.00000    327
14       -1  0.0051854993       -1        -1          -1        0.00000    469
15       -1  0.0005408284       -1        -1          -1        0.00000     30

マニュアルページ18は、次のことを示しています。

ここに画像の説明を入力してください

マニュアルに基づくと、最初の分割は、gbm1$var.names[3]「X3」である3番目の変数(この出力ではゼロ)で発生します。変数は順序付き因子です。

types<-lapply (lapply(data[,gbm1$var.names],class), function(i) ifelse (strsplit(i[1]," ")[1]=="ordered","ordered",i))

types[3]

したがって、分割は1.5であり、値'dおよびc' levels[[3]][1:2.5](これもゼロベース)が左ノードに分割され、他の値levels[[3]][3:4]は右に移動することを意味します。

次に、ルールは、gbm1$var.names[2]インデックス1の行のSplitVar=1で示されるように分割を続行します。

誰かがこのデータ構造を(ツリーごとに)移動するために何かを書き、次のようなルールを作成しましたか?

"X3 in('d'、'c')およびX2 <1.0309565491およびX3in('d')の場合、scoreTreeOne = -0.0102671518"

これが、このツリーの最初のルールが読み取る方法だと思います。

または、これを行うための最善の方法についてアドバイスがありますか?

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2 に答える 2

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mlmetaパッケージには、GBM モデルを R から SAS にエクスポートする関数 gbm2sas があります

于 2016-03-22T17:35:11.320 に答える
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これがどのように行われるかについての非常に一般的な答えです。

出力をファイルに書き込む R コードを追加します。https://stat.ethz.ch/R-manual/R-devel/library/base/html/sink.html

次に、SAS を介して、http ://support.sas.com/documentation/cdl/en/hostunx/61879/HTML/default/viewer.htm#a000303551.htm (知っておく必要がありますここで、R 実行可能ファイルは、上で記述した R コードを実行可能ファイルでポイントします)

そこから、SAS 内で出力を操作して、必要なスコアリングを実行できるはずです。

プロセスではなく 1 回限りのスコアリングである場合は、R の SAS 実行を省略し、R 出力ファイルを解析するための SAS コードを開発するだけです。

于 2014-09-25T19:41:07.540 に答える