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r - タイトル付きの .xls ファイルにデータ フレームを書き込む
パッケージから複数の (事後) 比較関数を複数の変数で実行するようにスクリプトを調整しました。これにより、複数のデータ フレームが生成され、次の (簡略化された) コードで .xls ファイルに個別のテーブルとして保存されます。私が望むのは、各日付フレームとともに、分析された変数 (列) の名前を、テーブルのタイトル(列のタイトルではなく) として保存することです。解決策を数時間探していますが、成功しません。これを行う方法?それらは多すぎるので、手動で入力したくありません。dunn.test
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r - dunn.test 出力 (R) としてテーブルを作成する方法は?
私はバクテリアのパイロシーケンシング データを扱っており、R を使用して統計分析を行っています。21 のサンプルと 7 つの異なる処理があります。データを R phyloseq にロードして、以下を取得しました。
トリートメント間に統計的に有意な差があることがわかったので (アドニス関数を使用)、どの OTU が異なるトリートメントで異なる量を持っているかを知りたいと思いました。これを行うために、関数 dunn.test (Kruskal-Wallis テストが組み込まれています) を使用し、最初に OTU テーブルの行と列を交換してテストを適用しました。
この再帰関数の出力は、特にすべての 7498 OTU の場合、非常に読みにくいものです。
Kruskal-Wallis + Dunn のテストを再帰的に適用して、テーブルを出力として、できれば有意性の順に、OTU コードだけでなく tax_table(psR) に含まれる分類学的識別とともに適用する方法はありますか?
どうもありがとうございました!
リディア
r - Rでカイ二乗の意味を見つけた
パッケージの関数からKruskal-Wallisカイ二乗の有意性 ( p-value ) を変数に抽出/コピーする必要がありますが、返されません。問題は、カイ 2 乗とそれに関連する自由度があれば、p 値はどのように計算できるかということです。dunn.test
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