問題タブ [ff]

ffオブジェクトから列を削除したい:

入力ファイルfile.txtは次のようにタブで区切られています。

ff次に、パッケージで読み取ります：

最初の列を除外したい (またはファイルのインポート時にスキップしたい)。通常のデータフレームまたはマトリックスを使用すると、次のようなコマンドを簡単に適用できます。

ただし、ffオブジェクト内では機能しません。何か案は？

パッケージffからオブジェクト内のすべての数値を log2 変換したいと思います。ff

私の使用df：

以下のコードを試しましたが、エラーが発生しました。

この関数をffオブジェクトに適用する方法はありますか?

私は ff パッケージを使用して保存している大きな行列 (1,140 行 x 1,140 行) を持っています。

これから共分散行列を計算する効率的な方法はありますか? cov 関数を使用すると、次のエラーが表示されます。

cov(X) のエラー: 'x' と 'y' の両方を指定するか、行列のような 'x' を指定してください

cov が ff オブジェクトを理解していないことを考えると、これは驚くべきことではありません。現在、単純なネストされた for ループを使用しています。

これは機能しますが、非常に遅いです。

何度も私はこれに足を踏み入れます：

私はすでに大きな ff オブジェクト (行列/配列で表される) を持っており、新しい列/行をそれに追加したいと考えています。更新されたデータがあり、新しい大きなオブジェクトを最初から作成したくないからです (これは非常に時間がかかる場合があります）。

私はそのようなことを試みています:

dim(ff.t) <- c(6, 4) ( , 値 = c(6, 4)) のエラーdim<-.ff:*tmp*最も速く回転するディム 1 のみを変更できます: dim<-( *tmp*, 値 = c(6, 4)) 2 : dim<-.ff( *tmp*, value = c(6, 4)) 3: stop("最も速く回転するディムのみを変更できます")

これは何を意味するのでしょうか ？これを回避し、ff オブジェクトに列/行を追加する方法はありますか (ファイルサイズも自然に増加します)。新しいオブジェクトの作成を避けられない場合、それを行う最善の方法は何ですか? 新しい列は、0 または NA で初期化できます。

ありがとう

私のデータは、何百万行もある以下のようになります。このテキストをテキスト ファイルにコピーして、以下の例で読み込むことができます。

上記のテキストを読み込んで、N、C、G、または T で始まる文字列の長さを判断しようとしています。通常は次のようにします。

ffパッケージで同じことをするにはどうすればよいですか？

さまざまなアプローチを試しましたが、どれも機能しません。