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r - ティブルにキャストする前に行名を変換するために data.frame にキャストする必要がありますか
名前付きマトリックスを出力する遺伝子発現パッケージを使用します。これを tibble にするには、まず最初に にキャストして、data.frame次に行名を変換できるようにする必要があります。これを行うより短い方法はありますか？例えば：
次のようなことをしたい場所：
as_tibbleしかし、ステップで行名を失うため、できません。
r - Tibbles は lubridate の期間オブジェクトと期間オブジェクトを拒否します
動作するコード:durationおよびperiodオブジェクト
次のコードは、durationオブジェクトとperiodオブジェクトをそれぞれ正常に生成します。
動作しないコード:durationおよびsperiod内のオブジェクトtibble
ただし、またはオブジェクトtibbleを使用してを作成しようとすると、情報が得られないエラー メッセージが表示されます。durationperiod
動作するコード:durationおよびsperiod内のオブジェクトdata.frame
tibble::tibble作品と交換base::data.frame。
動作しないコード - これらdata.frameの s を強制するtibbles
これらの stibble::as_tibbleを強制的に使用すると、以前と同じエラーが発生します。data.frametibbles
考えられる説明
Hadley は、この Github の問題 ( https://github.com/tidyverse/tibble/issues/326as.duration ) で、とを含む S4 列について言及していますas.period。非互換性については特に言及されていません。
ソースコードを掘り下げると、同じエラーメッセージを表示する次の依存関係のチェーンが見つかりました。as_tibble.data.frame --> list_to_tibble --> new_tibble
ではtibble:::list_to_tibble、 に渡される唯一の引数tibble::new_tibbleは ですx。したがって、 にsubclassは のデフォルト値が割り当てられ、NULLの最後から 2 番目の行は次のようにtibble::new_tibbleなります。
オブジェクトには構造がありますが、それらを直接呼び出そうとするとエラーが発生します。
その結果、data.frame xベクトルのクラスを割り当てると、エラーをスローする方法で強制しようとするようです。c("tbl_df", "tbl", "data.frame")Rx
さらに、tibble::tibbleも呼び出すことを考えるとas_tibble( ではありませんがdata.frame)、私の問題tibble::tibbleが同じ原因であると推測する危険があります。
パッケージのバージョン
- ティブル: 1.4.1
- 潤滑剤: 1.7.1
- R: 3.4.3