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r - cummeRbund csHeatmap 列のユーザー定義の順序
R パッケージ cummeRbund (Bioconductor から) を使用して RNA-seq データを視覚化しています。「DEG_genes」と呼ばれる cuffGeneSet インスタンスを作成しました。このインスタンスには、男性と女性の間で大幅に異なる発現を示す 662 の遺伝子が含まれています。私の目標は、csHeatmap() を使用してヒートマップを作成することです。このヒートマップでは、男性と女性のサンプル (複製) が分離されていますが、性別カテゴリ内で特定のユーザー定義の順序があります。私が使用した:
これは私が望むものをほとんど与えてくれます: ヒートマップは左側に女性、右側に男性を示していますが、アルファベット順に並べられています (女性_0、女性_1、女性_10、女性_11、女性_12...女性_19、女性_2、女性_20、女性_21..、女性_29左と同様に、男性のMale_0、Male_1、Male_10 ...Male_19、Male_2、Male_20 ...など)、特定の順序(clusterReps)にする必要があります。次のように、特定の順序で複製名を使用してテスト ベクトルを作成しました (左側の男性は 0 と 6 が交換され、右側は女性)。
「clusterReps」ベクトルの順序に従わなければならない列の順序を除いて、データをまったく同じにしたいと思います。ヒートマップが ggplot であることを知っていたので、過去 2 日間、どこでも解決策を探しましたが、成功しませんでした (stackoverflow の csHeatmap() の代わりに heatmap.2() に非常によく似た問題があるにもかかわらず、複製された fpkm 行列を取得しようとしました)。 heatmap.2 を使用しますが、heatmap_2 しか使用できず、一部のオプションは受け入れられませんでした)。使用:
x 軸のラベルのみが変更され、実際のデータは変更されません (ヒートマップは同一のままです)。ラベルだけでなく、列を再配置する同様の機能はありますか? よろしくお願いします。私は ggplot オブジェクト、特に cummeRbund のヒートマップの扱いに慣れていません。
編集:詳細情報として私が提供できるものは次のとおりです。
申し訳ありませんが、現時点ではこれ以上の情報を提供することはできません。コマンドを実行して出力を報告してほしい場合はお知らせください。
html - Notepad++ ユーザー定義言語を html に変換する
Notepad++ を使用してユーザー定義言語を作成しました。これをhtml形式に変換したいと思います。rtf ファイルを html に変換できる無料のソース ツールが多数ありますが、このユーザー定義言語ファイルを html に変換するにはどうすればよいですか?
Notepad++ を使用すると、このファイルをユーザー定義言語で拡張子を付けて保存できますが、書式設定されたテキストは notepad++ でのみ表示できます。
ファイルをdraft.rtfとして保存した場合と同様に、メモ帳++でファイルを開くと、変更(ユーザー定義言語の書式設定されたテキスト)は保持されますが、同じファイルをWordで開くと変更が失われます!
notepad++ から Word に単純にコピーして貼り付けるだけでも、テキストのユーザー定義言語仕様が失われます。親切に助けてください。
java - ユーザー定義のリンクリストからノードを削除した後の無限ループ (java)
このコードはdropClass
、ノードを
リンクされたリストとそれは機能しますが、印刷しようとするとtoString
無限にスタックします
follow.setNext(current);
ループの原因と思われるコード行が見つかりました
無限ループですが、修正するために何をすべきかわかりません。それを取り出しても、
node buts は正しく出力されます。ここで無限ループが発生しています
ループは の後while(current != null)
に始まります。ノードを削除しなければ完全に機能します。ノードを削除したときに何が間違っていたかを誰かが説明できますか?
編集: setNext メソッド本体
また、リンクされたリストを印刷するために使用しているループ
また、すべてのリンクされたリストが配列呼び出しリストにあることにも言及する必要があります
less - テーマに関係なく、Notepad++ でユーザー定義言語を機能させる
開発者がこの Web サイトで推奨していた Less スタイルをインポートしましたが、特定のテーマ専用に作成されているため、若干の問題があります。
XML ファイルを編集せずに、テーマに関係なくこの言語ファイルを機能させる方法はありますか? 組み込み言語のように。
notepad++ - ラベルをハイライトする方法
Notepad ++で独自のユーザー定義言語を作成しましたが、すべて正常に動作しますが、コロンで終わるすべてのテキストで定義されているすべてのラベルを強調表示したいと思います。
これを達成する方法はありますか?
mysql - MySQL再利用変数出力NULL
以下のSQLを使用しています。column1、column2 は 122.5014 および 4.2857 のような出力を提供します。しかし、私は48.9266を期待していましたが、出力NULLを与える最後の列。
SQL 入力:
出力: