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R にバイオコンダクター パッケージをインストールする際に問題があります。トランスクリプトは次のとおりです。

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
BiocInstaller version 1.4.4, ?biocLite for help
> biocLite("Biobase")
BioC_mirror: http://bioconductor.org
Using R version 2.15, BiocInstaller version 1.4.4.
Warning: unable to access index for repository http://brainarray.mbni.med.umich.edu/bioc/bin/macosx/leopard/contrib/2.15
Installing package(s) 'Biobase'
Error: Line starting '<!DOCTYPE html PUBLI ...' is malformed!
> traceback()
6: read.dcf(file = tmpf)
5: available.packages(contriburl = contriburl, method = method)
4: .install.macbinary(pkgs = pkgs, lib = lib, contriburl = contriburl, 
       method = method, available = available, destdir = destdir, 
       dependencies = dependencies, ...)
3: install.packages(pkgs = pkgs, lib = lib, repos = repos, ...)
2: biocLiteInstall(pkgs, ask = ask, siteRepos = siteRepos, suppressUpdates = suppressUpdates, 
       ...)
1: biocLite("Biobase")

Google で見つけた関連する質問は、インターネット接続エラー (プロキシなど) を示唆していますが、ここではそうではないようです。CRAN からパッケージを問題なくインストールできます: (つまり、install.packages("foreach"))

提案を歓迎します。

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これは、ビルドがシアトル時間の午前 10 時に終了するときに修正されるエラーだと思います。CRANextras リポジトリは Mac では利用できなくなり、リダイレクト ページの上部が表示されます。の後に BiocInstaller バージョン > 1.4.5 を探しsource("http://bioconductor.org/biocLite.R")ます。Bioconductor メーリング リストに電子メール スレッドがあります。

于 2012-05-31T15:33:20.650 に答える