確実なこと。最初に理解することは、これを行うための「1つの方法」がないということです。Doctrineは、関係を定義する方法に関して多くの柔軟性を提供します-複数の定義がまったく同じDDLを生成する場合でも(これを理解することが重要です-マッピングの選択の一部は、モデルではなく、ORMのオブジェクト側にのみ影響します-側)
これがユーザー/グループ/権限の例です。これは実際にはすべて多対多の関連付けです(PK列の定義など、関連性はないが必須のコードはすべて除外しました)
<?php
namespace Your\Bundle\Entity;
use Doctrine\ORM\Mapping as ORM;
use Doctrine\Common\Collections\ArrayCollection;
/**
 * @ORM\Entity
 */
class User
{
  /**
   * Many-To-Many, Unidirectional
   *
   * @var ArrayCollection $groups
   *
   * @ORM\ManyToMany(targetEntity="Group")
   * @ORM\JoinTable(name="user_has_group",
   *      joinColumns={@ORM\JoinColumn(name="user_id", referencedColumnName="id")},
   *      inverseJoinColumns={@ORM\JoinColumn(name="group_id", referencedColumnName="id")}
   * )
   */
  protected $groups;
  /**
   * Many-To-Many, Unidirectional
   *
   * @var ArrayCollection $permissions
   *
   * @ORM\ManyToMany(targetEntity="Permission")
   * @ORM\JoinTable(name="user_has_permission",
   *      joinColumns={@ORM\JoinColumn(name="user_id", referencedColumnName="id")},
   *      inverseJoinColumns={@ORM\JoinColumn(name="permission_id", referencedColumnName="id")}
   * )
   */
  protected $permissions;
  public function __construct()
  {
    $this->groups = new ArrayCollection();
    $this->permissions = new ArrayCollection();
  }
}
/**
 * @ORM\Entity
 */
class Group
{
  /**
   * Many-To-Many, Unidirectional
   *
   * @var ArrayCollection $permissions
   *
   * @ORM\ManyToMany(targetEntity="Permission")
   * @ORM\JoinTable(name="group_has_permission",
   *      joinColumns={@ORM\JoinColumn(name="group_id", referencedColumnName="id")},
   *      inverseJoinColumns={@ORM\JoinColumn(name="permission_id", referencedColumnName="id")}
   * )
   */
  protected $permissions;
  public function __construct()
  {
    $this->permissions = new ArrayCollection();
  }
}
/**
 * @ORM\Entity
 */
class Permission {}
ここで何が起こっているのかについて質問があれば、私に知らせてください。
さて、あなたの2番目の例に
<?php
namespace Your\Bundle\Entity;
use Doctrine\ORM\Mapping as ORM;
use Doctrine\Common\Collections\ArrayCollection;
/**
 * @ORM\Entity
 */
class Ticket
{
  /**
   * Many-To-One, Unidirectional
   *
   * @var Category
   *
   * @ORM\ManyToOne(targetEntity="Category")
   * @ORM\JoinColumn(name="category_id", referencedColumnName="id")
   */
  protected $category;
  /**
   * Many-To-Many, Unidirectional
   *
   * @var ArrayCollection $permissions
   *
   * @ORM\ManyToMany(targetEntity="Tag")
   * @ORM\JoinTable(name="tickt_has_tag",
   *      joinColumns={@ORM\JoinColumn(name="ticket_id", referencedColumnName="id")},
   *      inverseJoinColumns={@ORM\JoinColumn(name="tag_id", referencedColumnName="id")}
   * )
   */
  protected $tags;
  /**
   * One-To-Many, Bidirectional
   *
   * @var ArrayCollection $comments
   *
   * @ORM\OneToMany(targetEntity="Comment", mappedBy="ticket")
   */
  protected $comments;
  public function __construct()
  {
    $this->tags = new ArrayCollection();
    $this->comments = new ArrayCollection();
  }
}
/**
 * @ORM\Entity
 */
class Comment
{
  /**
   * Many-To-One, Bidirectional
   *
   * @var Ticket $ticket
   *
   * @ORM\ManyToOne(targetEntity="Ticket")
   * @ORM\JoinColumn(name="ticket_id", referencedColumnName="id")
   */
  protected $ticket=null;
}
/**
 * @ORM\Entity
 */
class Tag {}
/**
 * @ORM\Entity
 */
class Category {}
以前と同様に、これについて説明したい場合はお知らせください。
PSこれは実際にはテストされていません。IDEで非常に高速に実行しました。タイプミスが1つか2つあるかもしれません;)