アクセラレーションにCUDAを使用していませんが、SSLで最適化する必要があるアルゴリズムはAESではないと思います。AESはソフトウェアで非常に効率的になるように設計されており、最新のIntelプロセッサには、完全にハードウェアでAESのフルラウンドを実行するための特殊な命令さえあります。
さらに、最近の攻撃の中には、多くのサイトが優先暗号スイートをAESからRC4に、そしてソフトウェアでRC4をさらに高速に切り替えるように促しているものもあります。
SSLでは、これまで最も時間のかかる操作は、サーバーが最初のハンドシェイク中およびほとんどの暗号スイートに対して実行する必要のあるRSA秘密鍵の復号化でした。これが、90年代後半にeコマースWebサイト用の非常に多くのHWアクセラレータが市場に出回るようになった理由の1つです。ソフトウェアでのRSA復号化は非常に遅く、各Webサイトが維持できる負荷、つまり1秒あたりのTCP/SSL接続の数が制限されます。
私の知る限り、このトピックに関するいくつかの学術研究があります。GPUは、RSA(より正確には、大きな整数を使用したべき乗剰余)を効果的に高速化できますが、驚くほど大きな要因ではありません。さらに、使用しているグラフィックカードのモデルによっては、遅延も問題になる場合があります。しかし、GPUでRSAを実行するためのオープンソースソフトウェアはあまり見つかりません。opensslのようにSSLスタックに統合するソフトウェアは言うまでもありません。