talonmies、brano、huseyinは、すでにコードのいくつかの間違いを指摘しています。
拡散(熱)方程式は、CUDAで解ける偏微分方程式の古典的な例の1つです。CUDAbyExampleブックの第7章にも完全な例があります。
将来のユーザーへの参照として、CPUコードとGPUコードの両方を含む完全に機能する例を以下に示します。talonmiesによって提案されているように、ポインターを交換する代わりに、1つのループで2つのJacobi反復を凝縮しているだけです。
#include <iostream>
#include "cuda_runtime.h"
#include "device_launch_parameters.h"
#include "Utilities.cuh"
#define BLOCK_SIZE_X 16
#define BLOCK_SIZE_Y 16
/***********************************/
/* JACOBI ITERATION FUNCTION - GPU */
/***********************************/
__global__ void Jacobi_Iterator_GPU(const float * __restrict__ T_old, float * __restrict__ T_new, const int NX, const int NY)
{
const int i = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x ;
const int j = blockIdx.y * blockDim.y + threadIdx.y ;
// N
int P = i + j*NX; // node (i,j) |
int N = i + (j+1)*NX; // node (i,j+1) |
int S = i + (j-1)*NX; // node (i,j-1) W ---- P ---- E
int E = (i+1) + j*NX; // node (i+1,j) |
int W = (i-1) + j*NX; // node (i-1,j) |
// S
// --- Only update "interior" (not boundary) node points
if (i>0 && i<NX-1 && j>0 && j<NY-1) T_new[P] = 0.25 * (T_old[E] + T_old[W] + T_old[N] + T_old[S]);
}
/***********************************/
/* JACOBI ITERATION FUNCTION - CPU */
/***********************************/
void Jacobi_Iterator_CPU(float * __restrict T, float * __restrict T_new, const int NX, const int NY, const int MAX_ITER)
{
for(int iter=0; iter<MAX_ITER; iter=iter+2)
{
// --- Only update "interior" (not boundary) node points
for(int j=1; j<NY-1; j++)
for(int i=1; i<NX-1; i++) {
float T_E = T[(i+1) + NX*j];
float T_W = T[(i-1) + NX*j];
float T_N = T[i + NX*(j+1)];
float T_S = T[i + NX*(j-1)];
T_new[i+NX*j] = 0.25*(T_E + T_W + T_N + T_S);
}
for(int j=1; j<NY-1; j++)
for(int i=1; i<NX-1; i++) {
float T_E = T_new[(i+1) + NX*j];
float T_W = T_new[(i-1) + NX*j];
float T_N = T_new[i + NX*(j+1)];
float T_S = T_new[i + NX*(j-1)];
T[i+NX*j] = 0.25*(T_E + T_W + T_N + T_S);
}
}
}
/******************************/
/* TEMPERATURE INITIALIZATION */
/******************************/
void Initialize(float * __restrict h_T, const int NX, const int NY)
{
// --- Set left wall to 1
for(int j=0; j<NY; j++) h_T[j * NX] = 1.0;
}
/********/
/* MAIN */
/********/
int main()
{
const int NX = 256; // --- Number of discretization points along the x axis
const int NY = 256; // --- Number of discretization points along the y axis
const int MAX_ITER = 1; // --- Number of Jacobi iterations
// --- CPU temperature distributions
float *h_T = (float *)calloc(NX * NY, sizeof(float));
float *h_T_old = (float *)calloc(NX * NY, sizeof(float));
Initialize(h_T, NX, NY);
Initialize(h_T_old, NX, NY);
float *h_T_GPU_result = (float *)malloc(NX * NY * sizeof(float));
// --- GPU temperature distribution
float *d_T; gpuErrchk(cudaMalloc((void**)&d_T, NX * NY * sizeof(float)));
float *d_T_old; gpuErrchk(cudaMalloc((void**)&d_T_old, NX * NY * sizeof(float)));
gpuErrchk(cudaMemcpy(d_T, h_T, NX * NY * sizeof(float), cudaMemcpyHostToDevice));
gpuErrchk(cudaMemcpy(d_T_old, d_T, NX * NY * sizeof(float), cudaMemcpyDeviceToDevice));
// --- Grid size
dim3 dimBlock(BLOCK_SIZE_X, BLOCK_SIZE_Y);
dim3 dimGrid (iDivUp(NX, BLOCK_SIZE_X), iDivUp(NY, BLOCK_SIZE_Y));
// --- Jacobi iterations on the host
Jacobi_Iterator_CPU(h_T, h_T_old, NX, NY, MAX_ITER);
// --- Jacobi iterations on the device
for (int k=0; k<MAX_ITER; k=k+2) {
Jacobi_Iterator_GPU<<<dimGrid, dimBlock>>>(d_T, d_T_old, NX, NY); // --- Update d_T_old starting from data stored in d_T
Jacobi_Iterator_GPU<<<dimGrid, dimBlock>>>(d_T_old, d_T , NX, NY); // --- Update d_T starting from data stored in d_T_old
}
// --- Copy result from device to host
gpuErrchk(cudaMemcpy(h_T_GPU_result, d_T, NX * NY * sizeof(float), cudaMemcpyDeviceToHost));
// --- Calculate percentage root mean square error between host and device results
float sum = 0., sum_ref = 0.;
for (int j=0; j<NY; j++)
for (int i=0; i<NX; i++) {
sum = sum + (h_T_GPU_result[j * NX + i] - h_T[j * NX + i]) * (h_T_GPU_result[j * NX + i] - h_T[j * NX + i]);
sum_ref = sum_ref + h_T[j * NX + i] * h_T[j * NX + i];
}
printf("Percentage root mean square error = %f\n", 100.*sqrt(sum / sum_ref));
// --- Release host memory
free(h_T);
free(h_T_GPU_result);
// --- Release device memory
gpuErrchk(cudaFree(d_T));
gpuErrchk(cudaFree(d_T_old));
return 0;
}
このような例を実行するために必要なUtilities.cuファイルとUtilities.cuhファイルは、このgithubページで管理されています。