36

xtableとRMarkdownおよびknitrを使用して、\input{}で呼び出す.texファイルを生成しています。うまく機能しますが、ここに示すような複数列を作成する方法がわかりません。誰かがこれを行う方法を知っていますか?

これまで私が使用しているもの:

tbl <- xtable(data, align="l r r r r r")
colnames(tbl) <- c("Variable", 
                  "Mean", "Std Dev", 
                  "Mean", "Std Dev", 
                  "Difference")
caption(tbl) <- c("Table Title")
print(tbl, 
    include.rownames=FALSE,
    caption.placement="top",
    booktabs=TRUE,
    type="latex", 
    file="output.tex")

「Mean」と「StdDev」(「Treatment」と「Control」)ごとに異なるグループ化ヘッダーが必要です。

あるいは、R Markdown / knitrを使用してテーブルを自動的に生成するためのより良い方法はありますか?レポートは自動的に生成される必要があるため、テーブルを手動で編集したくありません。

更新: @agstudy:私はlatexを初めて使用しますが、これはxtable(またはxtableのようなもの)を使用して自動的に生成しようとしている出力だと思います。

\begin{tabular}{lrrrrr}
  \toprule
      & \multicolumn{2}{c}{Treatment} & \multicolumn{2}{c}{Control} & \\
  \cmidrule(lr){2-3} \cmidrule(lr){4-5}
  Variable & Mean & Std Dev & Mean & Std Dev & Difference \\ 
  \midrule
  var1 & 1 & 2 & 3 & 4 & 5 \\ 
  \bottomrule
\end{tabular}

更新2: @Jonathan:あなたが提案していることを理解するのに数回読んだ。私はあなたの推薦を受けました、そしてそれはうまくいきました。

Rマークダウンチャンクで私は今使用しています:

tbl <- xtable(data)
print(tbl,
    only.contents=TRUE,
    include.rownames=FALSE,
    type="latex",
    digits(tbl) <- c(0,1,1,1,1,1),
    file="output/tblout.tex")

次に、テキストでは、次を使用します。

\begin{tabular}{lddddd}
\toprule
    & \multicolumn{2}{c}{Treatment} & \multicolumn{2}{c}{Control} & \\
    \cmidrule(lr){2-3} \cmidrule(lr){4-5}
    Variable  &  \multicolumn{1}{r}{Mean}  &  \multicolumn{1}{r}{Std Dev}  &       \multicolumn{1}{r}{Mean}  &  \multicolumn{1}{r}{Std Dev}  &  \multicolumn{1}{r}{Difference}  \\
\midrule
\input{../output/tblout}
\bottomrule
\end{tabular}

ネイティブxtable(または他のパッケージ)ソリューションについて他に提案があるかどうかを確認します。そうでなければ、私はあなたの答えを受け入れます。ありがとう!

4

6 に答える 6

32

add.to.rowxtableのオプションはこれを完全に達成すると思います。

ここにサンプルコード:

require(xtable)
age <- sample(c('30-50', '50-70', '70+'), 200, replace=T)
sex <- sample(c('Male', 'Female'), 200, replace=T)
val <- table(age, sex)
val <- rbind(val, formatC(prop.table(val)*100, format='f', digits=1))
val <- structure(val, dim=c(3, 4))
val <- rbind(c('n', '%'), val)
rownames(val) <- c('', sort(unique(age)))
val <- xtable(val)


addtorow <- list()
addtorow$pos <- list(0)
addtorow$command <- paste0(paste0('& \\multicolumn{2}{c}{', sort(unique(sex)), '}', collapse=''), '\\\\')

print(val, add.to.row=addtorow, include.colnames=F)
于 2015-02-09T22:32:25.563 に答える
18

テーブルの形式が実行間で同じである(つまり、数値のみが変更されている)と仮定すると、only.contents引数を使用しprint.xtableて複数列のヘッダーを手動でコーディングすることをお勧めします。私の知る限りxtableでは、マルチカラムセル自体を実行することはできません。

于 2012-12-21T06:03:50.167 に答える
7

テーブルパッケージの使用を検討してください。

于 2012-12-25T05:30:38.113 に答える
5

kableExtraこれは、パッケージを使用した子供向けのゲームです。

\documentclass{article}
\usepackage{booktabs}
\begin{document}

<<setup, include=FALSE>>=
library(knitr)
opts_chunk$set(echo=FALSE)
library(kableExtra)
options(knitr.table.format = "latex")
mx <- matrix(1:6, ncol=3) 
rownames(mx) <- LETTERS[1:NROW(mx)] 
colnames(mx) <- sprintf("Col %s", LETTERS[1:NCOL(mx)])
@

<<results='asis'>>=
kable(mx, booktabs = TRUE, caption = "My table", align = "c") %>% 
  add_header_above(c(" ", "First"=2, "Second"=1)) %>% 
    kable_styling(latex_options = "hold_position")
@

<<results='asis'>>=
kable(mx, booktabs = TRUE, caption = "My other table", align = "c") %>% 
  add_header_above(c(" ", "First"=2, "Second"=1)) %>% 
    kable_styling(latex_options = "hold_position") %>% 
  group_rows("Nice!", 1, 2)
@

\end{document}

ここに画像の説明を入力してください

于 2017-08-01T13:58:36.857 に答える
1

通常、私は次のようなことをしています。

tableLines <- print (xtable (mymatrix)) ## no file
multicolumns <- "& \\\\multicolumn{3}{c}{A} & \\\\multicolumn{3}{c}{B} \\\\\\\\"
tableLines <- sub ("\\\\toprule\\n", paste0 ("\\\\toprule\n", multicolumns, "\n"), tableLines) ## booktabs = TRUE
tableLines <- sub ("\\\\hline\\n",   paste0 ("\\\\hline\n",   multicolumns, "\n"), tableLines) ## booktabs = FALSE
writeLines (tableLines, con = "myfile")

\\\\必要な多くに注意を払ってください。subおよびコマンドで円記号は失われpasteます。

于 2015-01-30T17:34:28.890 に答える
0

ここでのゲームに少し遅れたのが私の答えです。これはashkanに似ていますが、より一般的で、さまざまなパラメーターを使用できます。

まず第一に、なぜ新しい答えですか?さて、私はテーブル環境のない出力(rコード内ではなくtexドキュメント内にキャプションなどを書きたい)がkableExtra必要でしたが、提供されていないようです(間違っている場合は修正してください)。しかし、入力の柔軟性も必要でした(つまり、線の有無、スパンの違いなど)。

construct_header()結果は、ヘッダーを作成する関数です。

最初の簡単な例:

library(xtable)
set.seed(123)
df <- matrix(round(rnorm(16), 2), ncol = 4) 
df <- cbind(paste("Var", 1:4), df)
colnames(df) <- c("Var", rep(c("X", "Y"), 2))
df
#      Var     X       Y       X       Y      
# [1,] "Var 1" "-0.56" "0.13"  "-0.69" "0.4"  
# [2,] "Var 2" "-0.23" "1.72"  "-0.45" "0.11" 
# [3,] "Var 3" "1.56"  "0.46"  "1.22"  "-0.56"
# [4,] "Var 4" "0.07"  "-1.27" "0.36"  "1.79" 

a_header <- construct_header(
  # the data.frame or matrix that should be plotted  
  df,
  # the labels of the groups that we want to insert
  grp_names = c("", "Group A", "Group B"), 
  # the number of columns each group spans
  span = c(1, 2, 2), 
  # the alignment of each group, can be a single character (lcr) or a vector
  align = "c"
)

print(xtable(df), add.to.row = a_header, include.rownames = F, hline.after = F)
# % latex table generated in R 3.4.2 by xtable 1.8-2 package
# % Fri Oct 27 16:39:44 2017
# \begin{table}[ht]
# \centering
# \begin{tabular}{lllll}
#   \hline
#   \multicolumn{1}{c}{} & \multicolumn{2}{c}{Group A} & \multicolumn{2}{c}{Group B} \\  \cmidrule(lr){2-3} \cmidrule(lr){4-5}
#   Var & X & Y & X & Y \\ 
#   \hline
#   Var 1 & -0.56 & 0.13 & -0.69 & 0.4 \\ 
#   Var 2 & -0.23 & 1.72 & -0.45 & 0.11 \\ 
#   Var 3 & 1.56 & 0.46 & 1.22 & -0.56 \\ 
#   Var 4 & 0.07 & -1.27 & 0.36 & 1.79 \\ 
#   \hline
# \end{tabular}
# \end{table}

指定する必要があることに注意してくださいhline.after = FALSE(私にとって重要ですが、ここでは指定する可能性が省略されていますfloating = FALSE)。

これにより、このテーブルが作成されます(このアプローチでは、booktabsパッケージをLaTeXにロードする必要があることに注意してください)。

テーブル

行を省略しconstruct_header(..., draw_line = FALSE)、グループを整列させ、さまざまな方法でそれらをスパンさせるように指定できます。

ugly_header <- construct_header(df, c("One", "Two", "Three"), c(2, 1, 2), c("l", "c", "r"))
print(xtable(df), add.to.row = ugly_header, include.rownames = F, hline.after = F)

その結果、次のようになります。 ここに画像の説明を入力してください

関数のコードは次のとおりです。

#' Constructs a header i.e., groups for an xtable
#'
#' @param df a data.frame or matrix
#' @param grp_names the names of the groups
#' @param span where the groups span
#' @param align the alignment of the groups, defaults to center
#' @param draw_line if the group-names should be underlined
#'
#' @return a list that can be given to the \code{add.to.row} argument of the of \code{print.xtable}
#' @export
#'
#' @examples
#' library(xtable)
#' mx <- matrix(rnorm(16), ncol = 4) 
#' mx <- cbind(paste("Var", 1:4), mx)
#' colnames(mx) <- c("Var", rep(c("X", "Y"), 2))
#' 
#' addtorow <- construct_header(mx, c("", "Group A", "Group B"), span = c(1, 2, 2), "c")
#' print(xtable(mx), add.to.row = addtorow, include.rownames = F, hline.after = F)
construct_header <- function(df, grp_names, span, align = "c", draw_line = T) {
  if (length(align) == 1) align <- rep(align, length(grp_names))
  if (!all.equal(length(grp_names), length(span), length(align)))
    stop("grp_names and span have to have the same length!")

  if (ncol(df) < sum(span)) stop("Span has to be less or equal to the number of columns of df") 

  header <- mapply(function(s, a, grp) sprintf("\\multicolumn{%i}{%s}{%s}", s, a, grp),
                   span, align, grp_names)
  header <- paste(header, collapse = " & ")
  header <- paste0(header, " \\\\")

  if (draw_line) {
    # where do we span the lines:
    min_vals <- c(1, 1 + cumsum(span)[1:(length(span) - 1)])
    max_vals <- cumsum(span)
    line <- ifelse(grp_names == "", "", 
                   sprintf("\\cmidrule(lr){%i-%i}", min_vals, max_vals))
    line <- paste(line[line != ""], collapse = " ")

    header <- paste0(header, "  ", line, "\n  ")
  }

  addtorow <- list(pos = list(-1, -1, nrow(df)),
                   command = c("\\hline\n  ", header, "\\hline\n  "))
  return(addtorow)
}
于 2017-10-27T15:55:20.047 に答える