きちんと逃げられたとは思いません。検討:
// As you have it:
$cmd = "\"C:\Program Files (x86)\WinSCP\winSCP.exe\" /console /script=c:\wamp\www\client\transfer_script.txt";
echo $cmd;
> "C:\Program Files (x86)\WinSCP\winSCP.exe" /console /script=c:\wamp\www\client ransfer_script.txt
それは正しく見えません。引用符の外側でバックスラッシュを二重にエスケープしてみてください(スクリプトソースを指している場合)。
$cmd = "\"C:\Program Files (x86)\WinSCP\winSCP.exe\" /console /script=c:\\wamp\\www\\client\\transfer_script.txt";
echo $cmd;
> "C:\Program Files (x86)\WinSCP\winSCP.exe" /console /script=c:\wamp\www\client\transfer_script.txt
より良い。
アップデート
それでも問題が解決しない\\\\
場合は、Windowsで二重円記号が必要な場合に備えて、を使用して4つの記号でエスケープしてみます。エラーコードも確認することを検討してください。