SSMS 2008 R2 など、他の既存の SSMS インストールと一緒に SSMS 2012 をインストールすると、.SQL ファイルを開くための既定のプログラムを新しい SSMS 2012 バージョンに設定する際に問題が発生します。
.sql ファイルをクエリ ウィンドウにドラッグすると、正常に機能します。ただし、ユーザーが .sql ファイルをダブルクリックすると、2008 R2 の新しいインスタンスが .sql 関連エントリとして開くことができます。Default Open With で変更しても、新しいファイルをダブルクリックしても違いはありません。さらに、オープニングのコマンド ライン スクリプトを変更すると、SSMS 2012 で .sql をオープニングに変更できる可能性がありますが、既存のインスタンスを使用する代わりに ssms のインスタンスが繰り返されます (追加の負荷とメモリ使用量が発生します)。