以下のWebページに従って、LinuxにATLAS + Lapackをインストールしました。
http://math-atlas.sourceforge.net/atlas_install/node6.html
bunzip2 -c atlas3.10.1.tar.bz2 | tar xfm - # create SRCdir
mv ATLAS ATLAS3.10.1 # get unique dir name
cd ATLAS3.10.1 # enter SRCdir
mkdir Linux_C2D64SSE3 # create BLDdir
cd Linux_C2D64SSE3 # enter BLDdir
../configure -b 64 -D c -DPentiumCPS=2400 \ # configure command
--prefix=/home/whaley/lib/atlas \ # install dir
--with-netlib-lapack-tarfile=/home/whaley/dload/lapack-3.4.2.tgz
make build # tune & build lib
make check # sanity check correct answer
make ptcheck # sanity check parallel
make time # check if lib is fast
make install # copy libs to install dir
その後、 http://www.netlib.org/lapack/lapacke.htmlでサンプルを実行してみます
サンプルコード:
#include <stdio.h>
#include <lapacke.h>
int main (int argc, const char * argv[])
{
double a[5*3] = {1,2,3,4,5,1,3,5,2,4,1,4,2,5,3};
double b[5*2] = {-10,12,14,16,18,-3,14,12,16,16};
lapack_int info,m,n,lda,ldb,nrhs;
int i,j;
m = 5;
n = 3;
nrhs = 2;
lda = 5;
ldb = 5;
info = LAPACKE_dgels(LAPACK_COL_MAJOR,'N',m,n,nrhs,a,lda,b,ldb);
for(i=0;i<n;i++)
{
for(j=0;j<nrhs;j++)
{
printf("%lf ",b[i+ldb*j]);
}
printf("\n");
}
return(info);
}
ビルド ライブラリに iblapacke.a がないことがわかったので、このライブラリを myslef でビルドします。
cd lapack-3.4.2
cp make.inc.example make.inc
cd lapacke
make
そして、ついに iblapacke.a ができたので、上記のサンプルを次のようにコンパイルします。
g++ test3.cpp liblapacke.a -o test3.exe
次のエラーが表示されます。
liblapacke.a(lapacke_dgels_work.o): In function `LAPACKE_dgels_work':
lapacke_dgels_work.c:(.text+0x1dd): undefined reference to `dgels_'
lapacke_dgels_work.c:(.text+0x2b7): undefined reference to `dgels_'
私がグーグルした後、私は見つけました: http://www.netlib.org/lapack/explore-html/d7/d3b/group__double_g_esolve.html
Functions/Subroutines
subroutine dgels (TRANS, M, N, NRHS, A, LDA, B, LDB, WORK, LWORK, INFO)
DGELS solves overdetermined or underdetermined systems for GE matrices
関数 dgels があり、下線はありません。
http://shtools.ipgp.fr/www/faq.html#l4
事故で下線が引かれていると思いますが、
nm -A liblapacke.a |grep "dgels_"
liblapacke.a:lapacke_dgels.o: U LAPACKE_dgels_work
liblapacke.a:lapacke_dgels_work.o: U LAPACKE_dge_trans
liblapacke.a:lapacke_dgels_work.o:0000000000000000 T LAPACKE_dgels_work
liblapacke.a:lapacke_dgels_work.o: U LAPACKE_xerbla
liblapacke.a:lapacke_dgels_work.o: U dgels_
liblapacke.a:lapacke_dgels_work.o: U free
liblapacke.a:lapacke_dgels_work.o: U malloc
liblapack.a をビルドするときに「dgels」ではなく「dgels」をビルドするように下線を付けないようにする必要があると思います。これは、Lapack と ATLAS をビルドする何かを変更する必要があることを意味します。よろしくお願いします!!
関連するかどうかはわかりませんが、 -Ddgels=dgels_ が追加されていますが、同じリンクエラーです!!