Visual Studio 2012 Tools Command Line で次のコマンドを実行します。
"C:\source\Branch-1\.nuget\nuget.exe" install "C:\source\Branch-1\ClassLibs\WCF\ServiceHosts\PINPoller\packages.config" -source "" -RequireConsent -solutionDir "C:\source\Branch-1\"
エラーが発生しました：
Illegal characters in path.
これは、ソリューションのビルド時に発生するエラーです。手動でcmdにコピーしました。
更新しました：
フォルダ名はそこにあります：
C:\source\Branch-1.nuget
部分コマンドを実行すると、
"C:\source\Branch-1\.nuget\nuget.exe" install "C:\source\Branch-1\ClassLibs\WCF\ServiceHosts\PINPoller\packages.config" -source ""
それでいいです。