見つけるのに時間がかかりましたが、必要なものは Maven ビルド プラグインでした....
<build>
<plugins>
<plugin>
<!-- Build an executable JAR -->
<groupId>org.apache.maven.plugins</groupId>
<artifactId>maven-jar-plugin</artifactId>
<version>2.4</version>
<configuration>
<archive>
<manifest>
<addClasspath>true</addClasspath>
<mainClass>com.production.Main</mainClass>
</manifest>
</archive>
</configuration>
</plugin>
<plugin>
<artifactId>maven-assembly-plugin</artifactId>
<executions>
<execution>
<id>tar-assembly</id>
<phase>package</phase>
<goals>
<goal>single</goal>
</goals>
</execution>
</executions>
<configuration>
<archive>
<manifest>
<mainClass>com.production.Main</mainClass>
</manifest>
</archive>
<finalName>myapp</finalName>
<descriptorRefs>
<descriptorRef>with-dependencies</descriptorRef>
</descriptorRefs>
</configuration>
</plugin>
</plugins>
</build>