python - Pythonでフィッシャー基準を計算する

Question

2つのベクトルxとyが与えられたときにyが2クラス（0,1）である場合、ここの式に示すように、フィッシャー基準を計算するPythonモジュールはありますかhttp://compbio.soe.ucsc.edu /genex/genexTR2html/node12.html

私はフィッシャーの線形判別分析を適用しようとはしておらず、フィッシャー基準のみを適用しようとしていることに注意してください:)。

前もって感謝します！

Answer 1

私が知る限りではありませんが、あなたはあなた自身を書くことができます（この結果が正しいことをテストしてください、私は式の私の理解によってのみ行きます）。

import numpy as np

def fisher_criterion(v1, v2):
    return abs(np.mean(v1) - np.mean(v2)) / (np.var(v1) + np.var(v2))

これは、例えば、

>>> fisher_criterion([0, 1, 2], [0, 1])
0.54545454545454553

Answer 2

これは線形判別分析と非常によく似ています。これに満足している場合は、scikit-learnとmlpy、または多くの SVM パッケージのいずれかで十分に対応できます。