次の問題があります: R を使用してグラフとしてエクスポートすることにより ~100 MB のファイルを作成しました (したがって、必要に応じて再エクスポートできます)。gephi (0.8.2) でファイルを開く必要があります。 ~170k のエッジとすべてのノードにはいくつかの属性があります。
すべての属性を必要なものだけに減らしましたが、それでも Gephi は開きません。私は 4 GB のメモリを搭載したラップトップを実行しており (不要なものはすべてシャットダウンしました)、Java 64 ビットを使用しています。それでも、私はまだ次の問題を抱えています：
java.lang.RuntimeException: java.lang.IndexOutOfBoundsException: Index5、サイズ: 5
以前のようなメモリの問題ではないと思います。最も問題のある時点でも、まだ十分な (少なくとも 600 MB までの) 空きメモリがあります。構成ファイルは次のように設定されています: Xmx2827m
ファイルは現在 GML としてエクスポートされていますが、igraphがエクスポートできる任意の形式を使用できます。したがって、ノード、エッジ、および属性を含むファイルをgephiで開くことができるソリューションは大歓迎です。GML を選択したのは、属性をサポートする最小のファイル形式に思えたからです。
何か案は？
お時間をいただきありがとうございました！