問題タブ [gephi]

私はgephiを使用して、neo4jからグラフを視覚化しています。

この Java スニペットを使用して、すべてのノードを DFS の順序でトラバースし、ノード ID を出力しています。

私のグラフには、Neo4j にノード ID 1 から 222 までの 221 個のノードがあるとします (0 が参照ノードであるため)。

Gephi DataLaboratory を見ると、ノード ID 2 ～ 223 がグラフとして表示されます。Gephi は参照ノード ID 0 (Neo4j) を ID 1 (Gephi) にマッピングしているようです。これを防ぐことはできますか？なぜ Gephi はこれを行うのでしょうか?

Gephiを使用して、さまざまな組織のメンバーがどのように関係しているかを視覚化したいと思います。
私のソース資料は、基本的に組織とそのメンバーのリストで構成されています。

個人が異なる組織に現れることがあります（つまり、この例では個人1）。

質問：
1）組織間および組織内の関係が明らかになるように、この情報をエッジに変換するにはどうすればよいですか？

2）組織（タイプ）と個人（性別）に関するメタ情報もあり、視覚化に使用したい（レイアウト、色などに影響を与えるため）。これをエッジに関連して配置するにはどうすればよいですか？

ps。私はCIAのエージェントではありません。

次のようにPythonで生成されたgraphvizファイルがあります。

残念ながら、Gephi でグラフ ファイルを開くと、接続されていないノードは表示されません。少なくとも 1 つのエッジを接続すると、接続されたエッジのノードのみが表示されます。どうしたの？

Ruby を使用して、ネットワーク グラフを表す gexf 形式の XML 構造を構築しています。グラフは、いくつかのレベルのネストされたノードで構成されます。アイデアは、次のようなファイルを解析することです。

これを次のように変換します。

ご覧のとおり、ファイル内の行は特定の順序ではないため、XML ファイルを作成するときに各ノードとサブノードを参照できるようにする必要があります。

行を読んだときに、私の質問がまだ明確でない場合：

このノード「name6」を「最上位ノード b」と「中間ノード 1」内に固定するようビルダーに指示できるようにする必要があります。Builder や Nokogiri の Builder などで可能なことはありますか?

SVG を出力する Gephi で作成したネットワーク グラフに対話機能を追加しようとしています。ノードを SVG 円として入力するのが好きな Raphael テンプレートを使用しています。問題は、私の Gephi からの SVG 円が実際にはベジェ曲線であることです。例えば：

このようなパスを、x、y、および半径を持つ標準の SVG 円要素に変換する方法はありますか?

グラフへの影響に応じてノードのサイズを設定したいのですが、そのサイズを Gephi に表示する方法を見つける必要があります。現時点では、次のコードを使用しています。

しかし、これを Gephi にロードすると、ノードはすべて同じサイズになります。何か不足していますか？

私は数日間、トリッキーなデータセットで k-means とファジー c の両方を使用しており、結果はまあまあですが、グラフィカルな出力を視覚化して操作したいので、すばらしい視覚化ツールGephiを見つけました。メイン ページの画像をクリックすると、視聴できるビデオが読み込まれます。

ここのgephisがサポートするグラフ形式のページには、可能なインポート形式のリストがあります。

matlab を見ると、クラスター データを出力できる形式は csv である可能性があります。ここのgehpisサイトでは、フォーマット、エッジリスト、混合、マトリックスについて説明しています。

彼らが何を意味するのか本当にわかりません。matlab で FCM を使用すると、3 つの出力center、UおよびobjFunが得られます。

したがって、私の質問は、このデータから必要な形式で CSV ファイルを作成するにはどうすればよいかということです。

https://gephi.org/users/supported-graph-formats/spreadsheet/

http://forum.gephi.org/viewtopic.php?t=1896

この視覚化ツールは私がこれから使用したいものであり、これがどのように行われるかを説明するスタックに関する質問はまだないため、100 ポイントを支援できる人には報奨金を与えます。したがって、将来およびgephi/matlabユーザーのコミュニティに役立つ可能性があります.

ネットワークをgephiのジオレイアウトとしてigraphにプロットするためのジオレイアウトがあるかどうか疑問に思います。そうでない場合、緯度と経度に従ってノードをプロットするにはどうすればよいですか？

https://gephi.org/2010/map-geocoded-data-with-gephi/は、そのレイアウトのWebページです。[大円になるとは思いませんが、投影の選択肢は少ないです]

いくつかのダイナミクスを使用してソーシャルネットワーク分析グラフを作成したいと考えています。私が望むダイナミクスは、ノードの色とラベルを変更したい特定の日付ですが、リンクは同じままにしておきたいです。igraphR には、igraph0、などのソーシャル ネットワーク分析を行うパッケージがいくつかありますがnetwork、snaこれらのパッケージは視覚化に関してかなり制限されています。

私も Gephi を試してみましたが、特定の時点でノード/リンクを表示/非表示にするダイナミクスの点である程度の成功を収めました。（人々が望むなら、これのコードを与えることができます）。しかし、私が望むダイナミクスに関しては、上記の段落で述べたように、現時点でgephiはそのようなダイナミクスを実行できないことをオンラインで読みました。

したがって、私の質問は次のとおりです。そのようなダイナミクスを実行する Gephi バージョンはありますか、それとも、そのようなダイナミクスを実行するオープン ソースのソーシャル ネットワーキング分析視覚化ソフトウェアで最も優れているのはどれですか?

事前に乾杯

PS質問に何をタグ付けすればよいかわからなかったので、gephiとRを使用しました。使用すべきだったより良いタグがあれば修正してください。

ウェブ上でグラフを視覚化できるシンプルなアプリケーションを構築しようとしています。具体的には、私の目標は次のとおりです。

1. Gephi を使用してさまざまなズーム レベルでグラフをレンダリングする
2. 次に、これらの画像をタイルに切り分けたい
3. Google マップが使用するものと同様の Web コンポーネントまたはOpenLayersを使用して、これらのレイヤーをつなぎ合わせ、グラフのパン、ズームを可能にしたいと考えています。

これについて考えたとき、このアプローチは、複数のズーム レベルでデータを視覚化する必要があり、画像のレンダリングをサーバー側で行う必要がある任意のデータ視覚化に適用できると考えました。

そのようなアーキテクチャを実装するための標準スタックがあるかどうか (または、私が考えているアーキテクチャが理にかなっている場合でも) 知りたいです。

前もって感謝します。