文字列と double の混合型の大量の表形式データを処理する必要があります。標準的な問題だと思います。これを扱うためのMatlabの最良のデータ構造は何ですか?
Cellarray は間違いなく答えではありません。非常にメモリ効率が悪いです。(以下に示すテスト)。データセット (統計ツールボックスから) は時間と空間の効率が非常に悪いです。それは私に structarray または配列の構造体を残します。以下の時間とメモリの両方について、4つの異なるオプションすべてでテストを行いましたが、私がテストしたものには配列の構造体が最適なオプションであるように思えます。
私はMatlabに比較的慣れていないので、率直に言って、これは少し残念です。とにかく、何かが足りないかどうか、またはテストが正確/合理的かどうかについてのアドバイスを探しています。アクセス/変換/メモリ使用量以外に、このようなものを使用してより多くのコードを作成するときに発生する可能性がある他の考慮事項が欠けていますか? （ちなみにR2010bを使用しています）
* *テスト #1: アクセス速度 データ項目へのアクセス。
cellarray:0.002s
dataset:36.665s %<<< This is horrible
structarray:0.001s
struct of array:0.000s
* *テスト 2: 変換速度とメモリ使用量 このテストからデータセットを削除しました。
Cellarray(doubles)->matrix:d->m: 0.865s
Cellarray(mixed)->structarray:c->sc: 0.268s
Cellarray(doubles)->structarray:d->sd: 0.430s
Cellarray(mixed)->struct of arrays:c->sac: 0.361s
Cellarray(doubles)->struct of arrays:d->sad: 0.887s
Name Size Bytes Class Attributes
c 100000x10 68000000 cell
d 100000x10 68000000 cell
m 100000x10 8000000 double
sac 1x1 38001240 struct
sad 1x1 8001240 struct
sc 100000x1 68000640 struct
sd 100000x1 68000640 struct
================== コード: テスト#1
%% cellarray
c = cell(100000,10);
c(:,[1,3,5,7,9]) = num2cell(zeros(100000,5));
c(:,[2,4,6,8,10]) = repmat( {'asdf'}, 100000, 5);
cols = strcat('Var', strtrim(cellstr(num2str((1:10)'))))';
te = tic;
for iii=1:1000
x = c(1234,5);
end
te = toc(te);
fprintf('cellarray:%0.3fs\n', te);
%% dataset
ds = dataset( { c, cols{:} } );
te = tic;
for iii=1:1000
x = ds(1234,5);
end
te = toc(te);
fprintf('dataset:%0.3fs\n', te);
%% structarray
s = cell2struct( c, cols, 2 );
te = tic;
for iii=1:1000
x = s(1234).Var5;
end
te = toc(te);
fprintf('structarray:%0.3fs\n', te);
%% struct of arrays
for iii=1:numel(cols)
if iii/2==floor(iii/2) % even => string
sac.(cols{iii}) = c(:,iii);
else
sac.(cols{iii}) = cell2mat(c(:,iii));
end
end
te = tic;
for iii=1:1000
x = sac.Var5(1234);
end
te = toc(te);
fprintf('struct of array:%0.3fs\n', te);
================== コード: テスト #2
%% cellarray
% c - cellarray containing mixed type
c = cell(100000,10);
c(:,[1,3,5,7,9]) = num2cell(zeros(100000,5));
c(:,[2,4,6,8,10]) = repmat( {'asdf'}, 100000, 5);
cols = strcat('Var', strtrim(cellstr(num2str((1:10)'))))';
% c - cellarray containing doubles only
d = num2cell( zeros( 100000, 10 ) );
%% matrix
% doubles only
te = tic;
m = cell2mat(d);
te = toc(te);
fprintf('Cellarray(doubles)->matrix:d->m: %0.3fs\n', te);
%% structarray
% mixed
te = tic;
sc = cell2struct( c, cols, 2 );
te = toc(te);
fprintf('Cellarray(mixed)->structarray:c->sc: %0.3fs\n', te);
% doubles
te = tic;
sd = cell2struct( d, cols, 2 );
te = toc(te);
fprintf('Cellarray(doubles)->structarray:d->sd: %0.3fs\n', te);
%% struct of arrays
% mixed
te = tic;
for iii=1:numel(cols)
if iii/2==floor(iii/2) % even => string
sac.(cols{iii}) = c(:,iii);
else
sac.(cols{iii}) = cell2mat(c(:,iii));
end
end
te = toc(te);
fprintf('Cellarray(mixed)->struct of arrays:c->sac: %0.3fs\n', te);
% doubles
te = tic;
for iii=1:numel(cols)
sad.(cols{iii}) = cell2mat(d(:,iii));
end
te = toc(te);
fprintf('Cellarray(doubles)->struct of arrays:d->sad: %0.3fs\n', te);
%%
clear iii cols te;
whos