各行の列 2 と列 3 の平均を計算し、この値に 1 を加えて行全体を出力したいと思います。平均値の一部は浮動小数点数になります。
入力ファイルは次のようになります。
chr20 2330559 2330737
chr20 2332853 2333041
chr20 2537555 2537711
出力ファイル:
chr20 2330648 2330649
chr20 2332947 2332948
chr20 2537633 2537634
awk のさまざまな組み合わせを試しましたが、成功しませんでした。どんな提案も素晴らしいでしょう！ありがとうハリエット
これには awk を使用します。
awk '{$2=($2+$3)/2; $3=$2+1}1' file
int()関数を使用して、結果が整数であることを確認することもできます。
awk '{$2=int(($2+$3)/2); $3=$2+1}1' file
このワンライナーを試してください：
awk '{a=($2+$3)/2;$2=a;$3=a+1}7' file
それは与えます
chr20 2330648 2330649
chr20 2332947 2332948
chr20 2537633 2537634
何かのようなもの：
awk '{ printf("%s %d %d", $1, ($2 + $3) / 2, ($2 + $3) / 2 + 1) }'
平均が整数でない場合に何が起こるべきかについては、何の指示もありませんでした。