画像の外側を黒で塗りつぶす必要があるようです。これは、卵が白で分離されるため、卵を識別しやすくするためです。
しかし、寄生虫の卵が魔法のように青く見えたらどうなるでしょうか? これについてはすぐに説明しますが、このアプローチにより、新しいサンプルを分析する必要があるたびに画像をクリックする負担から解放されます。
私は答えを C++ で書きましたが、コードの動作に従えば、すぐに Python に変換できると確信しています。
#include <iostream>
#include <vector>
#include <opencv2/highgui.hpp>
#include <opencv2/imgproc.hpp>
int main(int argc, char* argv[])
{
// Load input image (3-channel)
cv::Mat input = cv::imread(argv[1]);
if (input.empty())
{
std::cout << "!!! failed imread()" << std::endl;
return -1;
}
// Convert the input to grayscale (1-channel)
cv::Mat grayscale = input.clone();
cv::cvtColor(input, grayscale, cv::COLOR_BGR2GRAY);
この時点でのグレースケールは次のようになります。
// Locate the black circular shape in the grayscale image
std::vector<std::vector<cv::Point> > contours;
cv::findContours(grayscale, contours, cv::RETR_LIST, cv::CHAIN_APPROX_SIMPLE);
// Fill the interior of the largest circular shape found with BLUE
cv::Mat circular_shape = input.clone();
for (size_t i = 0; i < contours.size(); i++)
{
std::vector<cv::Point> cnt = contours[i];
double area = cv::contourArea(cv::Mat(cnt));
if (area > 500000 && area < 1000000) // magic numbers to detect the right circular shape
{
std::cout << "* Area: " << area << std::endl;
cv::drawContours(circular_shape, contours, i, cv::Scalar(255, 0, 0),
cv::FILLED, 8, std::vector<cv::Vec4i>(), 0, cv::Point() );
}
}
この時点での circle_shapeは次のようになります。
// Create the output image with the same attributes of the original, i.e. dimensions & 3-channel, so we have a colored result at the end
cv::Mat output = cv::Mat::zeros(input.size(), input.type());
// copyTo() uses circular_shape as a mask and copies that exact portion of the input to the output
input.copyTo(output, circular_shape);
cv::namedWindow("Eggs", cv::WINDOW_NORMAL | cv::WINDOW_KEEPRATIO);
cv::imshow("Eggs", output);
cv::resizeWindow("Eggs", 800, 600);
cv::waitKey(0);
return 0;
}
ウィンドウに表示される出力は次のとおりです。
このソリューションの利点は、卵が既に青色に塗られているため、卵の検出を容易にするためにユーザーがアプリケーションと対話する必要がないことです。
この後、画像の残りの部分から色付きのオブジェクトを分離するなど、出力画像に対して他の操作を実行できます。cv::inRange()
したがって、完成させるために、テキスト/コードをさらに数行追加して、この時点から卵を画像の残りの部分から完全に分離するために何ができるかを示します。
// Isolate blue pixels on the output image
cv::Mat blue_pixels_only;
cv::inRange(output, cv::Scalar(255, 0, 0), cv::Scalar(255, 0, 0), blue_pixels_only);
この段階でblue_pixels_onlyがどのように見えるか:
// Get rid of pixels on the edges of the shape
int erosion_type = cv::MORPH_RECT; // MORPH_RECT, MORPH_CROSS, MORPH_ELLIPSE
int erosion_size = 3;
cv::Mat element = cv::getStructuringElement(erosion_type,
cv::Size(2 * erosion_size + 1, 2 * erosion_size + 1),
cv::Point(erosion_size, erosion_size));
cv::erode(blue_pixels_only, blue_pixels_only, element);
cv::dilate(blue_pixels_only, blue_pixels_only, element);
cv::imshow("Eggs", blue_pixels_only);
cv::imwrite("blue_pixels_only.png", blue_pixels_only);
この段階でblue_pixels_onlyがどのように見えるか: