2

一連の患者に由来するゲノム領域の範囲のリストがあります。

> head(dotoo)
GRanges with 6 ranges and 3 metadata columns:
    seqnames                 ranges strand |       Id       CN Histology
       <Rle>              <IRanges>  <Rle> | <factor> <factor>  <factor>
[1]        3 [167946693, 168005541]      * |        9        3        MD
[2]        3 [189907623, 189954633]      * |        9        3        MD
[3]        6 [132274121, 132384438]      * |        9        3        MD
[4]       11 [ 67685096,  70138399]      * |        9        4        MD
[5]       12 [ 53859037,  53927595]      * |        9        3        MD
[6]       15 [ 19830049,  20089383]      * |        9        1        MD

を使用してゲノム異常をプロットすると

autoplot(dotoo, aes(fill=as.factor(Id), color=as.factor(Id)))

多くの重複領域が表示されます。画像を参照してください

ここに画像の説明を入力

少なくとも 3 人の患者間で重複し、共有している領域を見つけるにはどうすればよいCNですか?

基本的に、写真を見ると、「重なり合っている」領域と、共有されている部分だけを見つけるにはどうすればよいでしょうか? まったく方法はありますか?

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