ディクショナリ (コードの最初のブロック) を作成しており、値に応じて不要なキーを除外し、これを CSV に出力できるようにしたいと考えています。
一致させたい値は、以下の 2 番目のコード ブロックで生成されたリストに格納されます。
すべて文字列で、整数ではありません。
これまでの私のコードは次のとおりです。
#new_dict = raw_input("Enter Dictionary Name")
#source: http://bit.ly/1iOS0e3
import csv
new_dict = {}
with open(raw_input("Enter csv file (including path)"), 'rb') as f:
reader = csv.reader(f)
for row in reader:
if row[0] in new_dict:
new_dict[row[0]].append(row[1:])
else:
new_dict[row[0]] = row[1:]
print new_dict
そしてリスト:
#modified from: http://bit.ly/1iOS7Gu
import pandas
colnames = ['Date Added to Catalog', 'PUBMEDID', 'First Author', 'Date', 'Journal', 'Link', 'Study', 'DT', 'Initial Sample Size', 'Replication Sample Size', 'Region', 'Chr_id', 'Chr_pos', 'Reported Gene(s)', 'Mapped_gene', 'p-Value', 'Pvalue_mlog', 'p-Value (text)', 'OR or beta', '95% CI (text)', 'Platform [SNPs passing QC]', 'CNV']
data = pandas.read_csv('C:\Users\Chris\Desktop\gwascatalog.csv', names=colnames)