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データ：

df <- structure(list(x = c(9.5638945103927, 13.7767187698566, 6.0019477258207, 
10.1897072092089, 15.4019854273531, 10.9746646056535, 12.9429073949468, 
20.7513493525379, 18.5764146937149, 2.91302077116471, 13.6523222711501, 
10.0920467755108), y = c(83.949498880077, 18.066881289085, 71.3052196358606, 
39.8975644317452, 57.2933166677927, 87.8484256883889, 92.6818329896141, 
49.8297961197214, 56.3650103496898, 14.7950650020996, 37.9271392096266, 
50.4357237591891), z = c("a", "c", "e", "f", "b", "a", "b", "a", 
"b", "a", "c", "d")), .Names = c("x", "y", "z"), row.names = c(NA, 
-12L), class = "data.frame")

私のモデル:

mod <- glm(y ~ x + I(x^2) + z, family=quasipoisson, data = df)
summary(mod)

私はこのようなものをプロットしたい:

ggplot(df, aes(x=x,y=y)) + 
  geom_point() +
  stat_smooth(method="lm",se=FALSE,
              formula=y~x+I(x^2),fill="transparent",
              colour="black") +
  stat_smooth(method="lm",geom="ribbon",
              formula=y~x+I(x^2),fill="transparent",
              colour="red",linetype="dashed",fullrange=TRUE) +
          scale_x_continuous(limits=c(-2,35)) +
          coord_cartesian(xlim=c(2,25),
                          ylim=range(pretty(df$y)))

ここに画像の説明を入力

しかし、私がプロットしたモデルは明らかに と同じモデルではmodありzませんquasiposson。

ggplot のようなものを実際のモデルを使用してプロットするにはどうすればよいですか? 私は見てきましたpredictが、私の場合のように複数の説明がある場合、どうすればよいか完全に失われています。でやっても構わないggplot2

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を使用して例を新しいモデルに簡単に適応させることができるようですが、式にstat_smooth(method='glm', family=quasipoisson, ...)を追加するzとエラーが発生します。ggplot2 docsを見るとpredictdf、間隔の制限を生成するために使用されていることがわかります。その関数のコードを見ると、x 次元全体の予測を処理することのみを意図しているように見えます。しかし、多次元で機能する独自のバージョンを簡単に作成し、極限を別のレイヤーとしてプロットできます。

mypredictdf <- function (model, newdata, level=0.95){
  pred <- stats::predict(model, newdata = newdata, se =TRUE, type = "link")
  std <- qnorm(level/2 + 0.5)
  data.frame(newdata,
             y = model$family$linkinv(as.vector(pred$fit)),
             ymin = model$family$linkinv(as.vector(pred$fit - std * pred$se)),
             ymax = model$family$linkinv(as.vector(pred$fit + std * pred$se)), 
             se = as.vector(pred$se))
}
px <- with(df, seq(from=min(x), to=max(x), length=100))
pdf <- expand.grid(x=px, z=unique(df$z))
pdf <- mypredictdf(mod, newdata=pdf)
g <- ggplot(data=pdf, aes(group=z))
g <- g + geom_point(data=df, aes(x=x, y=y, color=z))
g <- g + geom_ribbon(aes(x=x, ymin=ymin, ymax=ymax),
                     alpha=0.2)
g <- g + geom_line(aes(x=x, y=y, color=z))

1 パネル

ファセットは良い考えのようです：

g <- g + facet_wrap(~z)

ファセットバージョン

于 2014-03-15T00:11:58.570 に答える