合併により、ある Google Apps アカウントの下にドメイン A があり、別のアカウントの下にドメイン B があります。ドメイン B のすべてのユーザーのアカウントをドメイン A に作成して、後で移行を開始できます。アカウント A のドメインにエイリアスを追加することは問題ありません。
ただし、ドメイン B のアカウントとして電子メールを送信する (ユーザーは自分のアカウントで手動で要求できます。ドメイン B のアカウントには、許可するかどうかの質問がメールで送信されます) は、 Admin SDKでは可能ではないようです:
ホストされているドメインにユーザーまたはエイリアスとして存在する任意の電子メール アドレス。
他のユーザー/電子メール アドレスとしてメールを送信できるように手動で要求するときに、ユーザーが入力するプロセスを開始する方法はありますか?
ドメインを別の Google Apps アカウントに追加できるようにするには、ドメインを完全にシャットダウンする必要があるようです。