r - y値を考慮したggplot2の密度プロット

Question

私のデータには、x 軸ポイントと各 x 軸ポイントの y 値が含まれています。x 軸のポイントは均等に分散されていません。x 軸のポイントがどのようにクラスター化されているか、およびそのようなクラスターの y 値がどのように表示されるかを視覚化する必要があります。x 値がどのようにクラスター化されているかを確認するために、x 値に密度プロットをプロットできますが、そのクラスターの y 値は反映されません。たとえば、x 軸上の 100 点 (たとえば) が互いに非常に近く、すべてが正の y 値を持っている場合、その点でプロットを上げたい場合、それらの 100 個の点が負の y 値を持っている場合、プロットを下に移動したいこれらの 100 点に正と負の両方の y 値がある場合、プロットをゼロ点付近にする必要があります。同様に、それらの 100 個のポイントがすべて正の値を持っていても、それらが長距離に沿って散在している場合、プロットをゼロラインに近づけたいと考えています。

つまり、x ポイントの密度とその y 値の両方が重要であり、滑らかな線をプロットしたいと考えています。誰かがこれで私を助けてくれますか?(stat_smooth私のプロットがほぼ直線になるので、仕事をしませんでした)

ここに私のx軸とy軸の値があります（ここにテーブルを挿入する方法がわかりませんでした）

x 軸の値

Y 軸の値:

y_value
16.7
14.3
10.5
18.2
20.0
16.7
14.3
10.4
27.3
22.2
11.1
-18.2
-10.1
-13.3
-26.4
-13.3
-15.4
14.3
15.4
11.7
26.7
18.2
64.7
21.2
20.0
11.8
-17.9
25.0
14.2
20.0
18.2
12.5
12.5
10.5
11.1
12.5
14.3
-20.0
12.5
-20.0
16.7
13.3
18.2
20.0
30.0
20.0
11.8
-18.8
20.0
20.0
12.5
18.8
13.3
-15.4
18.2
18.9
28.6
20.0
12.5
16.1
15.4
10.5
13.3
29.7
23.1
18.2
14.3
12.5
12.5
16.7
11.1
20.0
18.2
18.2
13.2
13.3
11.8
15.4
14.3
23.8
18.2
33.3
18.2
-12.5
12.5
23.1
21.7
14.3
16.7
11.1
16.7
12.5
11.1
12.5
18.2
12.5
11.0
20.0
18.2
15.8
10.5
10.2
10.5
14.3
11.8
25.0
13.8
16.4
16.7
-18.2
18.2
16.7
18.2
18.2
11.8
12.5
14.3
17.9
10.5

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df注: 以下では、x と y のデータを列xとのデータフレームに結合しましたy。

単純な散布図を見ると、データは多かれ少なかれ 5 つのクラスターにグループ化されているように見えます。

with(df,plot(x,y))

x 方向と y 方向の両方の分布を確認するには、2 次元のカーネル密度推定が必要です。これは、パッケージで利用できますMASS。次に、パッケージzを使用して、これを 3 次元 (密度は ) でプロットできます。rgl

library(MASS)     # for kde2d(...)
library(rgl)      # for open3d(...) and surface3d(...)
dens <- kde2d(df$x,df$y)
zlim    <- range(dens$z)
palette <- rev(heat.colors(10))
col     <- palette[9*(dens$z-zlim[1])/diff(zlim) + 1] # assign colors to heights for each point
with(dens,open3d(scale=c(x=1/diff(range(x)),y=1/diff(range(y)),z=1/diff(range(z)))))
with(dens,surface3d(x,y,z, color=col))
title3d(xlab="X",ylab="Y")

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